1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtaaaatctcatatgtggttttgttcacttctcttctcattgcttctaccaaagtattgatgcattctttttttgcttcttggaagTTGTATGGATGAGATCTATGATAAGTTGGCGGAACGTCTTGTCCCTACAGCAGCGGCAATGTTTAGCCCCAATCTTAA
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G03030.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATTTCTTGCAGTCAGAAGAAAGATGTCACTGTTGTTGATGGAAG TTGTATGGATGAGATCTATGATAAGTTGGCGGAACGTCTTGTCCCTACAGCEST: gi|116454044|gb|EG496636.1|EG496636
genomic: ATTTCTTGCAGTCAGAAGAAAGATGTCACTGTTGTTGATGGAAGgtaaaatctc ... ttcttggaagTTGTATGGATGAGATCTATGATAAGTTGGCGGAACGTCTTGTCCCTACAGC
EST: ATTTCTTGCAGTCAGAAGAAAGATGTCACTGTTGTTGATGGAAG TTGTATGGATGAGATCTATGATAAGTTGGCGGAACGTCTTGTCCCTACAGCEST: gi|116454043|gb|EG496635.1|EG496635
genomic: ATTTCTTGCAGTCAGAAGAAAGATGTCACTGTTGTTGATGGAAGgtaaaatctc ... ttcttggaagTTGTATGGATGAGATCTATGATAAGTTGGCGGAACGTCTTGTCCCTACAGC
EST: ATTTCTTGCAGTCAGAAGAAAGATGTCACTGTTGTTGATGGAAG TTGTATGGATGAGATCTATGATAAGTTGGCGGAACGTCTTGTCCCTACAGC
genomic: ATTTCTTGCAGTCAGAAGAAAGATGTCACTGTTGTTGATGGAAGgtaaaatctc ... ttcttggaagTTGTATGGATGAGATCTATGATAAGTTGGCGGAACGTCTTGTCCCTACAGC
tcttctcattgcttctaccaaagtattgatgcattctttttttgcttcttggaagTTGTATGGATGAGATCTATGATAAGTTGGCGGAACGTCTTGTCCCTACAGCAGCGGCAATGTTTAGCCCCAATCTTAA
tattgat putative branch site (score: 3)
tgcattctttttttgc CT-rich tract
attcttttttt TA-rich tract