1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtaactaagtttcaggcttttatgagcactttgattatgctgtgtttctactgaatatgtgtgatttgttgtttaatgcttccttctggtttatgccttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTCGGGTCAG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv14s0066g02630.t01 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAG TTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGGTTTTGGTTTCEST: gi|351048068|gb|FQ441240.1|FQ441240
genomic: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTG-TTTTGGTTTC
EST: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAG TTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCCATGTTGTTTTTGGTT-CEST: gi|351037774|gb|FQ464215.1|FQ464215
genomic: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTT-GGTTTC
EST: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAG TTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTCGEST: gi|351044652|gb|FQ443183.1|FQ443183
genomic: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTCG
EST: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAG TTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTCGEST: gi|351053260|gb|FQ459128.1|FQ459128
genomic: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTCG
EST: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAG TTGATTCTCCATGCTATAGATACATTTCA-TGCCAATGTTGTTTTGGTTTCEST: gi|110422874|gb|EC989207.1|EC989207
genomic: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATT-CAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTC
EST: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAG TTGATTCTCCATGCTATAGATACTTTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTEST: gi|352789973|gb|FQ479583.1|FQ479583
genomic: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTT
EST: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGGTATGAG TTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTCGEST: gi|351046157|gb|FQ442535.1|FQ442535
genomic: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTCG
EST: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAG TTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTCGEST: gi|351037634|gb|FQ462618.1|FQ462618
genomic: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTCG
EST: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAG TTGATTCTTCATGCTATAGATACATTTCA-TGCCAATGT-GTTTTEST: gi|351039234|gb|FQ457909.1|FQ457909
genomic: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATT-CAATGCCAATGTTGTTTT
EST: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGGG TTGATTCTCCATGCTATCGATACATTTCA-TGCCAATGTTGTTTTGGTTTCEST: gi|351042381|gb|FQ442848.1|FQ442848
genomic: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATT-CAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTC
EST: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAG TTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTCGEST: gi|351056907|gb|FQ443534.1|FQ443534
genomic: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTCG
EST: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAG TTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGGTTTTGGTTTCEST: gi|110731309|gb|EE105610.1|EE105610
genomic: CTGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGATAGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTG-TTTTGGTTTC
EST: AGGCATGGTGATCANTACCATGGGATGGATTAGAGGGTGTTGGTTATGAG TTGATTCTCCATG
genomic: TGGCATGGTGATCAATACCATGGGATGGAT-AGAAGGTGTTGGTTATGAGgtaactaagt ... cttattgcagTTGATTCTCCATG
tgaatatgtgtgatttgttgtttaatgcttccttctggtttatgccttattgcagTTGATTCTCCATGCTATAGATACATTCAATGCCAATGTTGTTTTGGTTTCGGGTCAG
gtttaat putative branch site (score: 4)
ccttatt putative PPT
atttgttgtttaat TA-rich tract