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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatatatgttacttgctggtaacgtacagGCCGCTTTTCTAGATTTACCAATTGACTGGAAGAGGTACCTTGGTTTGATTATGTGGTATCAATTATCACCTGATACACCACTCGATATTATCATTCGTT

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM5G861959_T01
intron # 3
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gtatatatgttacttgctggtaacgtacagGCCGCTTTTCTAGATTTACCAATTGACTGGAAGAGGTACCTTGGTTTGATTATGTGGTATCAATTATCACCTGATACACCACTCGATATTATCATTCGTT
                                          tggtaac  putative branch site (score: 2)
                                                   tatatatgttactt  TA-rich tract