1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
gtgagctttgacattataattttggaactgcttagaagctcttttatgaaactaattggtatcttcttgcagGTTGTAGATGCTCTTTATGATTGCAAAAGTGAGGTGATTGGGCCAGGTTTTTTTAGATTCAAGGCTGAAATTG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G065839_T01 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTGATGATCATGACATGCAACGAGTCCTTGAATTTCTGAAGTCTGATCCG GTTGTAGATGCTCTTTATGATTGCAAAAGTGAGGTGATTGGGCCAGGNNNNEST: gi|67021225|gb|CO449974.1|CO449974
genomic: TTGATGATCATGACATGCAACGAGTCCTTGAATTTCTGAAGTCTGATCCGgtgagctttg ... cttcttgcagGTTGTAGATGCTCTTTATGATTGCAAAAGTGAGGTGATTGGGCCAGGTTTT
EST: TTGATGATCATGACATGCAACGAGTCCTTGAATTTCTGAAGTCTGATCCG GTTGTAGATGCTCTTTATGATTGCAAAAGTGAGGTGATTGGGCCAGGNNNNEST: gi|74233385|gb|DT641299.1|DT641299
genomic: TTGATGATCATGACATGCAACGAGTCCTTGAATTTCTGAAGTCTGATCCGgtgagctttg ... cttcttgcagGTTGTAGATGCTCTTTATGATTGCAAAAGTGAGGTGATTGGGCCAGGTTTT
EST: TGATCATGACATGCAACGAGTCCTTGAATTTCTGAAGTCTGATCCG GTTGTAGATGCTCTTTATGATTGCAAAAGTGAGGTGATTGGGCCAGGNNNNEST: gi|71318478|gb|DR796004.1|DR796004
genomic: TGATCATGACATGCAACGAGTCCTTGAATTTCTGAAGTCTGATCCGgtgagctttg ... cttcttgcagGTTGTAGATGCTCTTTATGATTGCAAAAGTGAGGTGATTGGGCCAGGTTTT
EST: TTGATGATCATGACATGCAACGAGTCCTTGAATTTCTGAAGTCTGATCCG GTTGTAGATGCTCTTTATGATTGCAAAAGTGAGGTGATTGGGCCAGGNNNN
genomic: TTGATGATCATGACATGCAACGAGTCCTTGAATTTCTGAAGTCTGATCCGgtgagctttg ... cttcttgcagGTTGTAGATGCTCTTTATGATTGCAAAAGTGAGGTGATTGGGCCAGGTTTT
aattttggaactgcttagaagctcttttatgaaactaattggtatcttcttgcagGTTGTAGATGCTCTTTATGATTGCAAAAGTGAGGTGATTGGGCCAGGTTTTTTTAGATTCAAGGCTGAAATTG
aactaat putative branch site (score: 43)
tatcttctt putative PPT
ttttatgaaactaatt TA-rich tract