1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gttagtctcccaaatgaagagcagatttagttgctctgttttacaggtgttgtagacattattaaatttcgactgtattctgatcctttaccacaaaacatgcagGTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTTCTACTATGCTATATTT
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G012284_T01 |
intron # | 10 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAA GTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTTEST: gi|67039856|gb|CO466111.1|CO466111
genomic: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAAgttagtctcc ... aaacatgcagGTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTT
EST: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAA GTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTTEST: gi|76288406|gb|DV027974.1|DV027974
genomic: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAAgttagtctcc ... aaacatgcagGTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTT
EST: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAA GTACAATGTTTTTCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTTEST: gi|91872772|gb|EB402729.1|EB402729
genomic: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAAgttagtctcc ... aaacatgcagGTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTT
EST: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAA GTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTTEST: gi|67024981|gb|CO453730.1|CO453730
genomic: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAAgttagtctcc ... aaacatgcagGTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTT
EST: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAA GTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTTEST: gi|71763789|gb|DR961726.1|DR961726
genomic: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAAgttagtctcc ... aaacatgcagGTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTT
EST: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAA GTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTTEST: gi|6952443|gb|AW424511.1|AW424511
genomic: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAAgttagtctcc ... aaacatgcagGTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTT
EST: ATTAAGTATCTTTACAA GTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTTEST: gi|71449543|gb|DR830593.1|DR830593
genomic: ATTAAGTATCTTTACAAgttagtctcc ... aaacatgcagGTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTT
EST: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAA GTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTTEST: gi|148962661|gb|EE013558.2|EE013558
genomic: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAAgttagtctcc ... aaacatgcagGTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTT
EST: TTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAA GTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTTEST: gi|33942467|gb|CF349067.1|CF349067
genomic: TTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAAgttagtctcc ... aaacatgcagGTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTT
EST: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAA GTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTT
genomic: ATATTTGGCCACACTTTGCAATCCCTTCGTGGAATTAAGTATCTTTACAAgttagtctcc ... aaacatgcagGTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTT
tgtagacattattaaatttcgactgtattctgatcctttaccacaaaacatgcagGTACAATGTTTTCCAGTATGGCTTTGTTGCTCTTGCCATCCTCACTCTCTTCTACTATGCTATATTT
ttctgat putative branch site (score: 355)
acattattaaattt TA-rich tract