1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
21 5' 3' | 22 5' 3' | 23 5' 3' | 24 5' 3' |
...aaaactactcaaggtcgtcgtcaacactgtttaaaagtagattttggaaatgtgtgttattaaaccgagcacctcacgagctattggttggtatctacagTGGGTTCCTCAAAACCCCTTCCCAGCAGCTATTTCGAATGCTACCTACTCCTGTGACAGCCAGCTTATTTATGCGGGCTTTGTTGATGGTTCTGTTGGGG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S99_260V6.1 |
intron # | 23 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
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ggaaatgtgtgttattaaaccgagcacctcacgagctattggttggtatctacagTGGGTTCCTCAAAACCCCTTCCCAGCAGCTATTTCGAATGCTACCTACTCCTGTGACAGCCAGCTTATTTATGCGGGCTTTGTTGATGGTTCTGTTGGGG
acctcac putative branch site (score: 19)
tgttattaaa TA-rich tract