1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' |
gtaagtgctatttatgctccctaaatcccttggttagggtagaatattaaaattgtggtatagtttatcgtctctcaacttttccatgttcttgagttacaagaacacagacgatgtattcaagtaatgttttatgatatcactctctgttatgtcgcagGTATCAATTGTTTTGAGAGGAGCTAATGACTACATGTTGGATGAGATGGAACGCTCTATTCATGATGCATTGAGCATTGTAAAACGTACTCTGGAATCAA
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S97_11V6.1 |
intron # | 12 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAATGAGTTCAAGAGCA GTATCAATTG-TTTGAGAGGAGCTAATGACTACATGTTGGATGAGATGGAAEST: gi|162260124|gb|FC435843.1|FC435843
genomic: CAATGAGTTCAAGAGCAgtaagtgcta ... tatgtcgcagGTATCAATTGTTTTGAGAGGAGCTAATGACTACATGTTGGATGAGATGGAA
EST: TATCTGATGACGATGTTATTCTTATTAAGGGTGCAATGAGTTCAAGAGCA GTATCAATTGTTTTGAGAGGAGCTAATGACTACATGTTGGATGAGATGGAAEST: gi|208392115|gb|DC957236.1|DC957236
genomic: TATCTGATGACGATGTTATTCTTATTAAGGGTGCAATGAGTTCAAGAGCAgtaagtgcta ... tatgtcgcagGTATCAATTGTTTTGAGAGGAGCTAATGACTACATGTTGGATGAGATGGAA
EST: TATCTGATGACGATGTTATTCTTATTAAGGGTGCAATGAGTTCAAGAGCA GTATCAATTGTTTTGAGAGGAGCTAATGACTACATGTTGGATGAGATGGAA
genomic: TATCTGATGACGATGTTATTCTTATTAAGGGTGCAATGAGTTCAAGAGCAgtaagtgcta ... tatgtcgcagGTATCAATTGTTTTGAGAGGAGCTAATGACTACATGTTGGATGAGATGGAA
cacagacgatgtattcaagtaatgttttatgatatcactctctgttatgtcgcagGTATCAATTGTTTTGAGAGGAGCTAATGACTACATGTTGGATGAGATGGAACGCTCTATTCATGATGCATTGAGCATTGTAAAACGTACTCTGGAATCAA
ctctctgtt CT-rich tract
taatgttttatgatat TA-rich tract