1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
TCTACCGGCAGGTGGTAGGGGAATGGGTAAAGGAATTGAGACTGGGACCAAATTGTACATCTCCAACCTTGATTATGGAGTCTCGAACGATGACATTAAGgtaaggttgcactacgcatgattgttaagcaacgaaatctagtaataagaacgagcgactatttctggttgctataatgtgtacgaggttcgtactggct...
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S77_164V6.2 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AA-TGTACATCTCCAACCNTGATTATGGAGTCTCGAACGATGACATTAAG GAATTGTTTTCGGAAGTTGGTGATTTGAAGAGATGCTCTATTAACTACGATEST: gi|67724423|gb|BJ974682.1|BJ974682
genomic: AATTGTACATCTCCAACCTTGATTATGGAGTCTCGAACGATGACATTAAGgtaaggttgc ... acccattcagGAATTGTTTTCGGAAGTTGGTGATTTGAAGAGATGCTCTATTAACTACGAT
EST: AATTGTACATCTCCAACCTTGATTATGGAGTCTCGAACGATGACATTAAG GAATTGTTTTCGGAAGTTGGTGATTTGAAGAGATGCTCTATTAACTACGATEST: gi|162211634|gb|FC387922.1|FC387922
genomic: AATTGTACATCTCCAACCTTGATTATGGAGTCTCGAACGATGACATTAAGgtaaggttgc ... acccattcagGAATTGTTTTCGGAAGTTGGTGATTTGAAGAGATGCTCTATTAACTACGAT
EST: TACATCTCCAACCTTGATTATGGAGTCTCGAACGATGACATTAAG GAATTGTTTTCGGAAGTTGGTGATTTGAAGAGATGCTCTATTAACTACGATEST: gi|67724216|gb|BJ974475.1|BJ974475
genomic: TACATCTCCAACCTTGATTATGGAGTCTCGAACGATGACATTAAGgtaaggttgc ... acccattcagGAATTGTTTTCGGAAGTTGGTGATTTGAAGAGATGCTCTATTAACTACGAT
EST: AATTGTACATCTCCAACCTTGATTATGGAGTCTCGAACGATGACATTAAG GAATTGTTTTCGGAAGTTGGTGATTTGAAGAGATGCTCTATTAACTACGAT
genomic: AATTGTACATCTCCAACCTTGATTATGGAGTCTCGAACGATGACATTAAGgtaaggttgc ... acccattcagGAATTGTTTTCGGAAGTTGGTGATTTGAAGAGATGCTCTATTAACTACGAT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TCTACCGGCAGGTGGTAGGGGAATGGGTAAAGGAATTGAGACTGGGACCAAATTGTACATCTCCAACCTTGATTATGGAGTCTCGAACGATGACATTAAGgtaaggttgcactacgcatgattgttaagcaacgaaatctagtaataagaacgagcgactatttctggttgctataatgtgtacgaggttcgtactggct
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