1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtaagtacctcgccgtaacatcagctttcaatgatcggggtttttattaaatagtcatggctgtatttggcaaatatcatgtttgttttgcaaatttttgagaacttacggagtgtaatgttcatgtggattgtcgggaaactagACGTGTACCTTGTGGGAACTGTGATGCTCATATTTGGAATGGGCTTATATGGACTGTTCATTAGCAACGAATCAAATGACGGAAAAAGTGATCGTGCATT
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S6_194V6.3 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAATGGATTGCACACGGGAAATGTAATCCTCCGACTTGTCGAAGCAGTTG ACGTGTACCTTGTGGGAACTGTGATGCTCATATTTGGAATGGGCTTATATGEST: gi|162228323|gb|FC404376.1|FC404376
genomic: GAATGGATTGCACACGGGAAATGTAATCCTCCGACTTGTCGAAGCAGTTGgtaagtacct ... gggaaactagACGTGTACCTTGTGGGAACTGTGATGCTCATATTTGGAATGGGCTTATATG
EST: GAATGGATTGCACACGGGAAATGTAATCCTCCGACTTGTCGAAGCAGTTG ACGTGTACCTTGTGGGAACTGTGATGCTCATATTTGGAATGGGCTTATATGEST: gi|208375595|gb|DC902812.1|DC902812
genomic: GAATGGATTGCACACGGGAAATGTAATCCTCCGACTTGTCGAAGCAGTTGgtaagtacct ... gggaaactagACGTGTACCTTGTGGGAACTGTGATGCTCATATTTGGAATGGGCTTATATG
EST: GAATGGATTGCACACGGGAAATGTAATCCTCCGACTTGTCGAAGCAGTTG ACGTGTACCTTGTGGGANCTGTGATGCTCATATTTGGAATGGGCTTATATG
genomic: GAATGGATTGCACACGGGAAATGTAATCCTCCGACTTGTCGAAGCAGTTGgtaagtacct ... gggaaactagACGTGTACCTTGTGGGAACTGTGATGCTCATATTTGGAATGGGCTTATATG
caaatttttgagaacttacggagtgtaatgttcatgtggattgtcgggaaactagACGTGTACCTTGTGGGAACTGTGATGCTCATATTTGGAATGGGCTTATATGGACTGTTCATTAGCAACGAATCAAATGACGGAAAAAGTGATCGTGCATT
aacttac putative branch site (score: 2)
taatgtt TA-rich tract