1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtaagtttcatatcaactgcgataactcgaatgactccttgcattgaatctattctcgctgtgaaataattatgtcctcattcaatccacggctagttcctttaagcaatttctttgaaaatctcatattcccttgtatgatagtttaatggtttcagtaaaaagctgcgtgggcactgcagGGCTATGGTTTGACGACGATGAGCTAATCCAATGGGACCAACACATGACCCCTTGGCTGAAAGAGTAG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S56_113V6.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAATGTTGTCCACGGTAGTGATAGTCCTGAGAATGGCCTCCGCGAACTTG GGCTATGGTTTGACGACGATGAGCTAATCCAATGGGACCAACACATGACCC
genomic: GAATGTTGTCCACGGTAGTGATAGTCCTGAGAATGGCCTCCGCGAACTTGgtaagtttca ... ggcactgcagGGCTATGGTTTGACGACGATGAGCTAATCCAATGGGACCAACACATGACCC
attcccttgtatgatagtttaatggtttcagtaaaaagctgcgtgggcactgcagGGCTATGGTTTGACGACGATGAGCTAATCCAATGGGACCAACACATGACCCCTTGGCTGAAAGAGTAG
gtttaat putative branch site (score: 3)
tatgatagtttaat TA-rich tract