Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|29681764|gb|CB678039.1|CB678039EST: TCCCAACATTGCTGTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATG GGTGTTTATGGGTACCCTATTGAGATTCAAGCCCTGTTCTTTATGGCACTA
genomic: TCCCAACATTGCTGTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATGgtaaacttta ... tttgttgtagGGTGTTTATGGGTACCCTATTGAGATTCAAGCCCTGTTCTTTATGGCACTA
EST:
gi|29632226|gb|CB637235.1|CB637235EST: TCCCAACATTGCTGTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATG GGTGTTTATGGGTACCCTATTGAGATTCAAGCCCTGTTCTTTATGGCACTA
genomic: TCCCAACATTGCTGTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATGgtaaacttta ... tttgttgtagGGTGTTTATGGGTACCCTATTGAGATTCAAGCCCTGTTCTTTATGGCACTA
EST:
gi|58655076|gb|CK043756.1|CK043756EST: TCCCAACATTGCTTTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATG GGTGTTTATGGGTACCCTATTGAGATTCAAGCCCTTTTCTTTATGGCACTA
genomic: TCCCAACATTGCTGTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATGgtaaacttta ... tttgttgtagGGTGTTTATGGGTACCCTATTGAGATTCAAGCCCTGTTCTTTATGGCACTA
EST:
gi|58665870|gb|CK054556.1|CK054556EST: TCCCAACATTGCTTTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATG GGTGTTTATGGGTACCCTATTGAG
genomic: TCCCAACATTGCTGTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATGgtaaacttta ... tttgttgtagGGTGTTTATGGGTACCCTATTGAG
EST:
gi|218499404|gb|FG963728.1|FG963728EST: TCCCAACATTGCTGTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATG GGTGTTTATGGGTACCCTATTGAGATTCAAGCCCTTTTCTTTATGGCACTA
genomic: TCCCAACATTGCTGTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATGgtaaacttta ... tttgttgtagGGTGTTTATGGGTACCCTATTGAGATTCAAGCCCTGTTCTTTATGGCACTA
EST:
gi|29681981|gb|CB678256.1|CB678256EST: TCCCAACATTGCTGTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATG GGTGTTTATGGGTACCCTATTGAGATTCAAGCCCTGTTCTTTATGGCACTA
genomic: TCCCAACATTGCTGTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATGgtaaacttta ... tttgttgtagGGTGTTTATGGGTACCCTATTGAGATTCAAGCCCTGTTCTTTATGGCACTA
EST:
gi|66928205|gb|CX115053.1|CX115053EST: GATAGATCGCAGAATG GGTGTTTATGGGTACCCTATTGAGATTCAAG-CCTTTTCTTTATGGCACTA
genomic: GATAGATCGCAGAATGgtaaacttta ... tttgttgtagGGTGTTTATGGGTACCCTATTGAGATTCAAGCCCTGTTCTTTATGGCACTA
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
GGGAATGAGGCTGATACTGAGCCTGTGCTTGTCTGAGGGGTTTGATACCTTCCCAACATTGCTGTGTGCAGACGGTTGCTGCATGATAGATCGCAGAATGgtaaactttactgtggcgctcaagttttttttttttataaaaacatgtttcaaactcacaagtgtataaactataattaacatttctattataacggaag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC