1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
...tgctttgtttcttaaatttttttcttctatcaactgtcatctcgaaaaccaaacagtaggaaaattaatatggctaacactttaagggtttatttaacagGTATCATCAAGTTGACAGTGATGATTTGACAATAGCAATTAACTTTTGGTGGAAGTCAAGAATAATGAATGAAATGTTAGAACATATGGATGCCTACTAT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g56640.2 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
aaaccaaacagtaggaaaattaatatggctaacactttaagggtttatttaacagGTATCATCAAGTTGACAGTGATGATTTGACAATAGCAATTAACTTTTGGTGGAAGTCAAGAATAATGAATGAAATGTTAGAACATATGGATGCCTACTAT
ggctaac putative branch site (score: 2)
tttattt putative PPT
taggaaaattaatat TA-rich tract