1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
AGTGCTGTTTCTCAACCGCCCAAGGACAAGTTTGAGACAAAATCGACAGTTTGGGCAGATACACTAAGCAGGGGGTTGGTTAATTTGAATATATCAGGACgtgagtgctgtgcttataccttctcaaactattttcaatgtgtgatcttatctggatgaacactgacttttcgtgttgttcatttgcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G39180.1 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTGGGCAGATACACTAAGCAGGGGGTTGGTTAATTTGAATATATCAGGAC CTAAATTAAACCCTTTAGCATATATTGGAGTTGACTTTGATGCCATTAATAEST: gi|51344023|gb|CO984756.1|CO984756
genomic: TTGGGCAGATACACTAAGCAGGGGGTTGGTTAATTTGAATATATCAGGACgtgagtgctg ... tcatttgcagCTAAATTAAACCCTTTAGCATATATTGGAGTTGACTTTGATGCCATTAATA
EST: TTGGGCAGATACACTAAGCAGGGGGTTGGTTAATTTGAATATATCAGGAC CTAAATTAAACCCTTTAGCACATATTGGAGTTGACTTTGATGCCATTAATAEST: gi|9564554|gb|BE474063.1|BE474063
genomic: TTGGGCAGATACACTAAGCAGGGGGTTGGTTAATTTGAATATATCAGGACgtgagtgctg ... tcatttgcagCTAAATTAAACCCTTTAGCATATATTGGAGTTGACTTTGATGCCATTAATA
EST: TTGGGCAGATACACTAAGCAGGGGGTTGGTTAATTTGAATATATCAGGAC CTAAATTAAACCCTTTAGCATATATTGGAGTTGACTTTGATGCCATTAATA
genomic: TTGGGCAGATACACTAAGCAGGGGGTTGGTTAATTTGAATATATCAGGACgtgagtgctg ... tcatttgcagCTAAATTAAACCCTTTAGCATATATTGGAGTTGACTTTGATGCCATTAATA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AGTGCTGTTTCTCAACCGCCCAAGGACAAGTTTGAGACAAAATCGACAGTTTGGGCAGATACACTAAGCAGGGGGTTGGTTAATTTGAATATATCAGGACgtgagtgctgtgcttataccttctcaaactattttcaatgtgtgatcttatctggatgaacactgacttttcgtgttgttcatttgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGAT