1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
GTGAGGTTGGAAGCACAAACTGATTATTGCTGGCTGTGCGAATGGCCACAGgtttgtgtctttctactgatgtagttcctattattattagattagcaactgtgtgtgtgtgtgtgttgaacaagtgttaagtgctttttttttttctgtgcttaattcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G36490.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGAGGTTGGAAGCACAAACTGATTATTGCTGGCTGTGCGAATGGCCCCAG AAATTGTTGATTCCATTTGAGATGCGGGGGTACCAAGGTGTTTATAACCTGEST: gi|26058846|gb|CA801760.1|CA801760
genomic: TGAGGTTGGAAGCACAAACTGATTATTGCTGGCTGTGCGAATGGCCACAGgtttgtgtct ... cttaattcagAAATTGTTGATTCCATTTGAGATGCGGGGGTACCAAGGTGTTTATAACCTG
EST: TGAGGTTGGAAGCACAAACTGATTATTGCTGGCTGTGCGAATGGCCCCAG AAATTGTTGATTCCATTTGAGATGCGEST: gi|298163414|gb|HO012147.1|HO012147
genomic: TGAGGTTGGAAGCACAAACTGATTATTGCTGGCTGTGCGAATGGCCACAGgtttgtgtct ... cttaattcagAAATTGTTGATTCCATTTGAGATGCG
EST: TGAGGTTGGAAGCACAAACTGATTATTGCTGGCTGTGCGAATGGCCCCAG AAATTGTTGATTCCATTTGAGATGCGGGGGTACCAAGGTGTTTATAACCTEST: gi|298193002|gb|HO033447.1|HO033447
genomic: TGAGGTTGGAAGCACAAACTGATTATTGCTGGCTGTGCGAATGGCCACAGgtttgtgtct ... cttaattcagAAATTGTTGATTCCATTTGAGATGCGGGGGTACCAAGGTGTTTATAACCT
EST: TGAGGTTGGAAGCACAAACTGATTATTGCTGGCTGTGCGAATGGCCCCAG AAATTGTTGATTCCATTTGAGATGCGGGGGTACCAAGGTGTTTATAACCTGEST: gi|24136047|gb|BU926557.1|BU926557
genomic: TGAGGTTGGAAGCACAAACTGATTATTGCTGGCTGTGCGAATGGCCACAGgtttgtgtct ... cttaattcagAAATTGTTGATTCCATTTGAGATGCGGGGGTACCAAGGTGTTTATAACCTG
EST: TGAGGTTGGAAGCACAAACTGATTATTGCTGGCTGTGCGAATGGCCCCAG AAATTGTTGATTCCATTTGAGATGCGGGGGTACCAAGG
genomic: TGAGGTTGGAAGCACAAACTGATTATTGCTGGCTGTGCGAATGGCCACAGgtttgtgtct ... cttaattcagAAATTGTTGATTCCATTTGAGATGCGGGGGTACCAAGG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTGAGGTTGGAAGCACAAACTGATTATTGCTGGCTGTGCGAATGGCCACAGgtttgtgtctttctactgatgtagttcctattattattagattagcaactgtgtgtgtgtgtgtgttgaacaagtgttaagtgctttttttttttctgtgcttaattcag
- - - TGGAAG