1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
ACTCCTGCACTTGAAGGAATTAAGCTTGTAAAATCAGAGCAAGGAGAAATTTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatcatggtccctcaaattgttactgtcgcaagacagtggataaagaaaggcaaatatgttatttgggcctttttcagtgttttttttttcttc...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G34980.2 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAG ACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACAEST: gi|58015415|gb|CX702157.1|CX702157
genomic: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatc ... cttatggcagACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
EST: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAATCATATACTGCCTGTTATAG ACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACAEST: gi|151400774|gb|EV270588.1|EV270588
genomic: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatc ... cttatggcagACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
EST: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCCGTTATAG ACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACAEST: gi|21888981|gb|BQ742194.1|BQ742194
genomic: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatc ... cttatggcagACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
EST: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAG ACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACAEST: gi|58015688|gb|CX702430.1|CX702430
genomic: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatc ... cttatggcagACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
EST: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAATCATATACTGCCTGTTATAG ACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
genomic: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatc ... cttatggcagACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ACTCCTGCACTTGAAGGAATTAAGCTTGTAAAATCAGAGCAAGGAGAAATTTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatcatggtccctcaaattgttactgtcgcaagacagtggataaagaaaggcaaatatgttatttgggcctttttcagtgttttttttttcttc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ccctcaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gataaaga