1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
GGATGGTCTTAGGGGTTTCTTTCGTGGAACCGGAGCTACCTTGTGCCGCGAGGTTCCATTTTATGTTGCTGGCATGGGGCTTTATGCTGAATCTAAAAAGgtgtgtaatttccatgatccagtgtgcttgatcttgtgtttgtcaatggaatttacattttttatttatgcattgtaactataatatctgagactttggt...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G31800.1 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTCCATTTTATGTTGCTGGCATGGGGCTTTATGCTGAATCTAAAAAG GTTGCCGAACGACTACTAGAGCGGGAACTCGGTCCCTTGGAAACAATTGCTEST: gi|22930143|gb|BU547282.1|BU547282
genomic: TTCCATTTTATGTTGCTGGCATGGGGCTTTATGCTGAATCTAAAAAGgtgtgtaatt ... ttgattttagGTTGCCGAACGACTACTAGAGCGGGAACTCGGTCCCTTGGAAACAATTGCT
EST: AGGTTCCATTTTATGTTGCTGGCATGGGGCTTTATGCTGAATCTAAAAAG GTTGCCGAACGACTACTAGAGCGGGAACTCGGTCCCTTGGAAACAATTGCTEST: gi|120531774|gb|EH259907.1|EH259907
genomic: AGGTTCCATTTTATGTTGCTGGCATGGGGCTTTATGCTGAATCTAAAAAGgtgtgtaatt ... ttgattttagGTTGCCGAACGACTACTAGAGCGGGAACTCGGTCCCTTGGAAACAATTGCT
EST: AGGTTCCAATTTATGTTGCTGGCATGGGGCTTTATGCTGAATCTAAAAAG GTTGCCGAACGACTACTAGAGCGGGAACTCGGTCCCTTGGAAACAATTGCTEST: gi|17519837|gb|BM188879.1|BM188879
genomic: AGGTTCCATTTTATGTTGCTGGCATGGGGCTTTATGCTGAATCTAAAAAGgtgtgtaatt ... ttgattttagGTTGCCGAACGACTACTAGAGCGGGAACTCGGTCCCTTGGAAACAATTGCT
EST: AGGTTCCATTTTATGTTGCTGGCATGGGGCTTTATGCTGAATCTAAAAAG GTTGCCGAACGACTACTAGAGCGGGAACTCGGTCCCTTGGAAACAATTGCT
genomic: AGGTTCCATTTTATGTTGCTGGCATGGGGCTTTATGCTGAATCTAAAAAGgtgtgtaatt ... ttgattttagGTTGCCGAACGACTACTAGAGCGGGAACTCGGTCCCTTGGAAACAATTGCT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGATGGTCTTAGGGGTTTCTTTCGTGGAACCGGAGCTACCTTGTGCCGCGAGGTTCCATTTTATGTTGCTGGCATGGGGCTTTATGCTGAATCTAAAAAGgtgtgtaatttccatgatccagtgtgcttgatcttgtgtttgtcaatggaatttacattttttatttatgcattgtaactataatatctgagactttggt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG