Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GATTTCAGCATTTGGATGTGGAATACTGATAATGCTGCCTTACTTAATACATTTATTGGTCATGGTGATAGTGTAACCTGTGGTGATTTTACTCCCGATGgtagtaatttctcttcatcttggtgcattttttgttaaatgttatttgtggtatatatttttacactcttccatttctttttacttggtaccttag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G31330.1
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|51343389|gb|CO984122.1|CO984122
EST:     ATTTATTGGTCATGGTGATAGTGTAACCTGTGGTGATTTTACNCCCGATG                         GGAAAATAATATGTACTGGTTCTGATGATGCAACCTTGAGAATATGGAATC
genomic: ATTTATTGGTCATGGTGATAGTGTAACCTGTGGTGATTTTACTCCCGATGgtagtaattt ... ggtaccttagGGAAAATAATATGTACTGGTTCTGATGATGCAACCTTGAGAATATGGAATC
EST: gi|23051895|gb|BU577114.1|BU577114
EST:     ATTTATTGGTCATGGTGATAGTGTAACCTGTGGTGATTTTACTCCCGATG                         GGAAAATAATATGTACTGGTTCTGATGATGCAACCTTGAGAATATGGAATC
genomic: ATTTATTGGTCATGGTGATAGTGTAACCTGTGGTGATTTTACTCCCGATGgtagtaattt ... ggtaccttagGGAAAATAATATGTACTGGTTCTGATGATGCAACCTTGAGAATATGGAATC
EST: gi|192310896|gb|FK000343.1|FK000343
EST:     ATTTATTGGTCATGGTGATAGTGTAACCTGTGGTGATTTTACTCCCGATG                         GGAAAATAATATGTACTGGTTCTGATGATGCAACCTTGAGAATATGGAATC
genomic: ATTTATTGGTCATGGTGATAGTGTAACCTGTGGTGATTTTACTCCCGATGgtagtaattt ... ggtaccttagGGAAAATAATATGTACTGGTTCTGATGATGCAACCTTGAGAATATGGAATC