Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CAATGCCAGCGGCTGAAATGTCTTTCCATGGATGAGGAAGTTTGCTTCTTTTGTGGGGAAATTGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAGgtatgctaaaattttaaagctttttatgaaatggttgtatttttaatttttttaatgagaattgtgtcaaaactgtatgaagcatggaattgttaatttt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G29820.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193479708|gb|FK448189.1|FK448189
EST:     TTGTGGGGAAATTGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAG                         GGGGAGGAAGGTTTGCTAAGTGCTTACTCTGTTATGGACATGGACACTTCA
genomic: TTGTGGGGAAATTGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAGgtatgctaaa ... ggtgatgcagGGGGAGGAAGGTTTGCTAAGTGCTTACTCTGTTATGGACATGGACACTTCA
EST: gi|11689795|gb|BF597471.1|BF597471
EST:     TTGTGGGGAAATTGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAG                         GGGGAGGAAGGTTTGCTAAGTGCTTACTCTGTTATGGACATGGACACTTCA
genomic: TTGTGGGGAAATTGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAGgtatgctaaa ... ggtgatgcagGGGGAGGAAGGTTTGCTAAGTGCTTACTCTGTTATGGACATGGACACTTCA
EST: gi|51343595|gb|CO984328.1|CO984328
EST:     TTGTGGGGAAATTGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAG                         GGGGAGGAAGGTTTGCTAAGTGCTTACTCTGTTATGGACATGGACACTTCA
genomic: TTGTGGGGAAATTGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAGgtatgctaaa ... ggtgatgcagGGGGAGGAAGGTTTGCTAAGTGCTTACTCTGTTATGGACATGGACACTTCA
EST: gi|193528423|gb|FK483953.1|FK483953
EST:     TTGTGGGGAAATTGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAG                         GGGGAGGAAGGTTTGCTAAGTGCTTACTCTGTTATGGACATGGACACTTCA
genomic: TTGTGGGGAAATTGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAGgtatgctaaa ... ggtgatgcagGGGGAGGAAGGTTTGCTAAGTGCTTACTCTGTTATGGACATGGACACTTCA
EST: gi|208326330|gb|GE120712.1|GE120712
EST:     TGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAG                         GGGGAGGAAGGTTTGCTAAGTGCTTACTCTGTTATGGACATGGACACTTCA
genomic: TGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAGgtatgctaaa ... ggtgatgcagGGGGAGGAAGGTTTGCTAAGTGCTTACTCTGTTATGGACATGGACACTTCA
EST: gi|207783914|gb|GD756894.1|GD756894
EST:     TTGTGGGGAAATTGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAG                         GGGGAGGAAGGTTTGCTAAGTGCTTACTCTGTTATGGACATGGACACTTCA
genomic: TTGTGGGGAAATTGGACATTCCCTTGGAAAATGCGATGTGTCTCAAGCAGgtatgctaaa ... ggtgatgcagGGGGAGGAAGGTTTGCTAAGTGCTTACTCTGTTATGGACATGGACACTTCA