1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
CAAGGTCTTGGAGTGATTGCATGCATTGGAGAATTGTTAGAAGAAAGGGAAGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAGgtagtggaagttatgtttcttatataatccatttaaaattcgttttcttttgatttagaagaaacaaaaggggaaggatttggtggttgattgcattacatcgtttgccattatttacag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G36990.2 |
intron # | 6 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAG ATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGGEST: gi|20814775|gb|BQ299253.1|BQ299253
genomic: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAGgtagtggaag ... ttatttacagATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGG
EST: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAG ATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTGATTGCATATGAACCTGTATGGGEST: gi|8283483|gb|BE021042.1|BE021042
genomic: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAGgtagtggaag ... ttatttacagATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGG
EST: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAG ATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGGEST: gi|12689031|gb|BG155376.1|BG155376
genomic: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAGgtagtggaag ... ttatttacagATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGG
EST: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAG ATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGGEST: gi|15204307|gb|BI427075.1|BI427075
genomic: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAGgtagtggaag ... ttatttacagATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGG
EST: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAG ATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGGEST: gi|8284792|gb|BE022351.1|BE022351
genomic: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAGgtagtggaag ... ttatttacagATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGG
EST: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAG ATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGGEST: gi|192326679|gb|FK018521.1|FK018521
genomic: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAGgtagtggaag ... ttatttacagATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGG
EST: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAG ATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGG
genomic: AGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAGgtagtggaag ... ttatttacagATGCAGTTCCTAGCTGGGACAACATTGTTATTGCATATGAACCTGTATGGG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CAAGGTCTTGGAGTGATTGCATGCATTGGAGAATTGTTAGAAGAAAGGGAAGCTGGAAAAACTTTTGATGTTTGTTTTCAGCAATTGAAGGCTTATGCAGgtagtggaagttatgtttcttatataatccatttaaaattcgttttcttttgatttagaagaaacaaaaggggaaggatttggtggttgattgcattacatcgtttgccattatttacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG