1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtattttactattttattttatttcctttgaattgaacgttgattctttcagattctaattgaaattccctttcttaacagGAAAAAGCTACCTAAACCCGTGGATTTAACGGAGGTCCTTGACTTCAGATCTATTCTAGAATGCTATCTCCAAAACGATGTGCTTCCTCCGGGTGTTATC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA18G00970.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTTCTTCCAAGAACAAAAG GAAAAAGCTACCTAAACCCGTGGATTTAACGGAGGTCCTTGACTTCAGATCEST: gi|213620336|gb|DB961481.1|DB961481
genomic: CTTCTTCCAAGAACAAAAGgtattttact ... ttcttaacagGAAAAAGCTACCTAAACCCGTGGATTTAACGGAGGTCCTTGACTTCAGATC
EST: AAGAAGTACAAGCTCTACTACGACAACAATGCTTCTTCCAAGAACAAAAG GAAAAAGCTACCTAAACCCGTGGATTTAACGGAGGTCCTTGACTTCAGATC
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tttgaattgaacgttgattctttcagattctaattgaaattccctttcttaacagGAAAAAGCTACCTAAACCCGTGGATTTAACGGAGGTCCTTGACTTCAGATCTATTCTAGAATGCTATCTCCAAAACGATGTGCTTCCTCCGGGTGTTATC
ttctaat putative branch site (score: 2)
ttccctttcttaac putative PPT
attctaattgaaatt TA-rich tract