Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|193336253|gb|FK301093.1|FK301093EST: TGACAAGTTCGATGCTATGCTGTTAAAGGGCAATGTTTATGCACCAGATG CTTTGTTTAGATGGGGTGTGGCATTGCAGCAGCGATCTCGCTTAAGGCCGG
genomic: TGACAAGTTCGATGCTATGCTGTTAAAGGGCAATGTTTATGCACCAGATGgtattatgtc ... tgaattgcagCTTTGTTTAGATGGGGTGTGGCATTGCAGCAGCGATCTCGCTTAAGGCCGG
EST:
gi|192314067|gb|FK008807.1|FK008807EST: TGACAAGTTCGATGCTATGCTGTTAAAGGGCAATGTTTATGCACCAGATG CTTTGTTTAGATGGGGTGTGGCATTGCAGCAGCGATCTCGCTTAAGGCCGG
genomic: TGACAAGTTCGATGCTATGCTGTTAAAGGGCAATGTTTATGCACCAGATGgtattatgtc ... tgaattgcagCTTTGTTTAGATGGGGTGTGGCATTGCAGCAGCGATCTCGCTTAAGGCCGG
EST:
gi|51337969|gb|CO981835.1|CO981835EST: TGACAAGTTGGATGTTATGCTGTTAAAGGGCAATGTTTATGCACCAGATG CTTTGTTTAGATGGGGTGTGGCATTGCAGCAGCGATCTCGATTAAGACCGG
genomic: TGACAAGTTCGATGCTATGCTGTTAAAGGGCAATGTTTATGCACCAGATGgtattatgtc ... tgaattgcagCTTTGTTTAGATGGGGTGTGGCATTGCAGCAGCGATCTCGCTTAAGGCCGG
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
GGTGCTGCTTTTGAGGCTGAAAGAGTGTTCTTGGCTGCAATTGACAAGTTCGATGCTATGCTGTTAAAGGGCAATGTTTATGCACCAGATGgtattatgtctattttcctgaatttgttatttataattctaatatacaggtgcaactagagaatattatgctgacagattctccataaaagtatatagcc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGATG