1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
...aacaaaattcggtcttttattagagaccttaaacatatttaagccaaatttaattgttagtagttcatgaaaattaacaacagtatgtcttttcgtgcagTTTTTGGTTATGAACCACATTCAGTTTTGCCAATTGGAGTTGTTGCATTAGCTGACAACACATGTTTTATGCCTCTTCCTAAAATAAAAGTTCTTGCTAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G21960.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACGCTTCATGTGGAGGATATGAAGGCTTTTCATCCCAGTCGTGCTTATG TTTTTGGTTATGAACCACATTCAGTTTTGCCAATTGGAGTTGTTGCATTAGEST: gi|20815058|gb|BQ299536.1|BQ299536
genomic: ACGCTTCATGTGGAGGATATGAAGGCTTTTCATCCCAGTCGTGCTTATGgtgtgtccca ... tttcgtgcagTTTTTGGTTATGAACCACATTCAGTTTTGCCAATTGGAGTTGTTGCATTAG
EST: CACGCTTCATGTGGAGGATATGAAGGCTTTTCATCCCAGTCGTGCTTATG TTTTTGGTTATGAACCACATTCAGTTTTGCCAATTGGAGTTGTEST: gi|27446115|gb|CA953238.1|CA953238
genomic: CACGCTTCATGTGGAGGATATGAAGGCTTTTCATCCCAGTCGTGCTTATGgtgtgtccca ... tttcgtgcagTTTTTGGTTATGAACCACATTCAGTTTTGCCAATTGGAGTTGT
EST: CACGCTTCATGTGGAGGATATGAAGGCTTTTCATCCCAGTCGTGCTTATG TTTTTGGTTATGAACCACATTCAGTTTTGCCAATTGGAGTTGTTGCATTAG
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aaatttaattgttagtagttcatgaaaattaacaacagtatgtcttttcgtgcagTTTTTGGTTATGAACCACATTCAGTTTTGCCAATTGGAGTTGTTGCATTAGCTGACAACACATGTTTTATGCCTCTTCCTAAAATAAAAGTTCTTGCTAG
aattaac putative branch site (score: 2)
tgtcttttc putative PPT
ttcatgaaaattaa TA-rich tract