Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCTTACTACCTTCCCGAGACAGAATATGTGCACTGGGCACGAGCACACCCGgtaagaatatccacctaccacagtatcgttacacatctaattgcacggaggttttaactaagctcatcctaattcttgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA12G08830.1
intron # 24
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|51336220|gb|CO980086.1|CO980086
EST:     CTTACTACCTTCCCGAGACAGAATATGTGCACTGGGCACGAGCACACCCG                         GAATACAGTAAAAGCCAGATTGTTGGACTGGTCAACCTTGTTGCCACTATG
genomic: CTTACTACCTTCCCGAGACAGAATATGTGCACTGGGCACGAGCACACCCGgtaagaatat ... attcttgcagGAATACAGTAAAAGCCAGATTGTTGGACTGGTCAACCTTGTTGCCACTATG
EST: gi|42722693|gb|CK768592.1|CK768592
EST:     CTTACTACCTTCCCGAGACAGAATATGTGCACTGGGCACGAGCACACCCG                         GAATACAGTAAAAGCCAGATTGTTGGACTGGTCAACCTTGTTGCCACTATG
genomic: CTTACTACCTTCCCGAGACAGAATATGTGCACTGGGCACGAGCACACCCGgtaagaatat ... attcttgcagGAATACAGTAAAAGCCAGATTGTTGGACTGGTCAACCTTGTTGCCACTATG
EST: gi|58014856|gb|CX701598.1|CX701598
EST:     CTTACTACCTTCCCGAGACAGAATATGTGCACTGGGCACGAGCACACCCG                         GAATACAGTAAAAGCCAGATTGTTGGACTGGTCAACCTTGTTGCCACTATG
genomic: CTTACTACCTTCCCGAGACAGAATATGTGCACTGGGCACGAGCACACCCGgtaagaatat ... attcttgcagGAATACAGTAAAAGCCAGATTGTTGGACTGGTCAACCTTGTTGCCACTATG
EST: gi|42722559|gb|CK768458.1|CK768458
EST:     CTTACTACCTTCCCGAGACAGAATATGTGCACTGGGCACGAGCACACCCG                         GAATACAGTAAAAGCCAGATTGTTGGACTGGTCAACCTTGTTGCCACTATG
genomic: CTTACTACCTTCCCGAGACAGAATATGTGCACTGGGCACGAGCACACCCGgtaagaatat ... attcttgcagGAATACAGTAAAAGCCAGATTGTTGGACTGGTCAACCTTGTTGCCACTATG