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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGAGCTGTGCGGTACGCTCAAGAATATCGTGGCCCTGGGTGTGGGCATGGTGGACGGCCTGGGCATGGGACCCAACTCCAAGGCCGCTATCATCCGCCAGgtgcgtgccgtgtgtgtgcgtgcgtgcatgtcatataggaagctcaagaagaggggattctggcatcgtgactgcactcctcccacctcccctcaccccctcatcccatcccaactctgcctccctccctcgtctcggggcccccctcccctcag

Basic information

species Chlamydomonas reinhardtii
transcript EDP09534
intron # 13
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|14227845|gb|BG846661.1|BG846661
EST:     GGGACGGCCTGGGCATGGGACCCAACTCCAAGGCCGCTATCATCCGCCAG                         GGCCTGCTTGAGATGCGTGACTTCTGCCAGGCCCTCTACCCCTCCGTCCGC
genomic: -GGACGGCCTGGGCATGGGACCCAACTCCAAGGCCGCTATCATCCGCCAGgtgcgtgccg ... ctcccctcagGGCCTGCTTGAGATGCGTGACTTCTGCCAGGCCCTCTACCCCTCCGTCCGC
EST: gi|22056096|gb|BQ812188.1|BQ812188
EST:     TGGACGGCCTGGGCATGGGACCCAACTCCAAGGCCGCTATCATCCGCCAG                         GGCCTGCTTGAGATGCGTGACTTCTGCCAGGCCCTCTACCCCTCCGTCCGC
genomic: TGGACGGCCTGGGCATGGGACCCAACTCCAAGGCCGCTATCATCCGCCAGgtgcgtgccg ... ctcccctcagGGCCTGCTTGAGATGCGTGACTTCTGCCAGGCCCTCTACCCCTCCGTCCGC