1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtttcaatttttcttctttgttttggctctgttttcctctgtttctaactttctatgattgattcttcatgatgggttcttttgaacaaaacaaagtttgattttttatatatatttcctatgcagGTTTGATCGTAGGTCCAATTGCTGGATTAACATTAATAGTTGGGAATGTTGGAGTGATTCTTTGTTTGTTCCCTGCACATGTTACTTGGACTATTTACGC
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT4G37030.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTATGTCATCTTTGCCTTTTGTTCTGCTTTCTTTCTCGGTGCTATCAAAG GTTTGATCGTAGGTCCAATTGCTGGATTAACATTAATAGTTGGGAATGTTGEST: gi|116405845|gb|EG448437.1|EG448437
genomic: TTATGTCATCTTTGCCTTTTGTTCTGCTTTCTTTCTCGGTGCTATCAAAGgtttcaattt ... tcctatgcagGTTTGATCGTAGGTCCAATTGCTGGATTAACATTAATAGTTGGGAATGTTG
EST: CTTTCTCGGTGCTATCAAAG GTTTGATCGTAGGTCCAATTGCTGGATTAACATTAATAGTTGGGAATGTTG
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atgggttcttttgaacaaaacaaagtttgattttttatatatatttcctatgcagGTTTGATCGTAGGTCCAATTGCTGGATTAACATTAATAGTTGGGAATGTTGGAGTGATTCTTTGTTTGTTCCCTGCACATGTTACTTGGACTATTTACGC
gtttgat putative branch site (score: 5)
tatttcct putative PPT
ttttgaacaaaacaaa TA-rich tract