1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtgctttctctcgcctcatcttagctttcatgttcatacaaacttgatgtaaacaggcagtgaaataacagacttgagataaaatactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATGCCCATGATTGATCAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT2G18230.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAG GAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATGEST: gi|116443156|gb|EG485748.1|EG485748
genomic: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAGgtgctttctc ... tactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATG
EST: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAG GAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATGEST: gi|164044854|gb|ES067559.1|ES067559
genomic: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAGgtgctttctc ... tactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATG
EST: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAG GAGCCTGTGCTAACCGGATCAEST: gi|164017123|gb|ES146359.1|ES146359
genomic: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAGgtgctttctc ... tactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCA
EST: GTAC-GATGCAG GAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATGEST: gi|164064113|gb|ES130650.1|ES130650
genomic: GTACTGATGCAGgtgctttctc ... tactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATG
EST: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAG GAGCCTGTGCTAACCGGATCAEST: gi|116390040|gb|EG432632.1|EG432632
genomic: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAGgtgctttctc ... tactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCA
EST: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAG GAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATGEST: gi|116443161|gb|EG485753.1|EG485753
genomic: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAGgtgctttctc ... tactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATG
EST: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAG GAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATGEST: gi|116390041|gb|EG432633.1|EG432633
genomic: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAGgtgctttctc ... tactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATG
EST: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAG GAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATGEST: gi|116451434|gb|EG494026.1|EG494026
genomic: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAGgtgctttctc ... tactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATG
EST: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAG GAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATGEST: gi|86075558|gb|DR371315.1|DR371315
genomic: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAGgtgctttctc ... tactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATG
EST: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAG GAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATGEST: gi|116451435|gb|EG494027.1|EG494027
genomic: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAGgtgctttctc ... tactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATG
EST: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAG GAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATG
genomic: GAACTATCTGTGAAGACAGTGATCCAATGGATGTCCTGGTACTGATGCAGgtgctttctc ... tactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATG
aaacttgatgtaaacaggcagtgaaataacagacttgagataaaatactgtgcagGAGCCTGTGCTAACCGGATCATTCCTCCGTGCCCGTGCTATTGGTCTAATGCCCATGATTGATCAG
aaataac putative branch site (score: 2)
agataaaata TA-rich tract