1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
GTTTTGGTCCAGGAGGTCCTGGTTTTGGTGGCCGGGGCCCGAGAGGTCCTGGTTTTGGCCCAAGAGGCCCTGGTCCTTGGAGTGGCCCAAGAGgtcctcgtcctggtggaggaggaggccctggtcctggtccttggagtggcccaagag
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT2G04170.3 |
intron # | 1 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CCTGGTCCTTGGAGTGGCCCAAGAG GTCCTCGTCCTGGCGGAGGAGGAGGTCCTGGTTCTGGTTGTGGCTCAGGGAEST: gi|116387844|gb|EG430436.1|EG430436
genomic: CCTGGTCCTTGGAGTGGCCCAAGAGgtcctcgtcc ... ggcccaagagGTCCTCGTCCTGGCGGAGGAGGAGGTCCTGGTTCTGGTTGTGGCTCAGGGA
EST: TCCTGGTTTTGGTGGCCGGGGCCCGAGAGGTCCTGGTTTTGGCCCAAGAGGCCCTGGTCCTTGGAGTGGCCCAAGAGEST: gi|116387843|gb|EG430435.1|EG430435
genomic: TCCTGGTTTTGGTGGCCGGGGCCCGAGAGGTCCTGGTTTTGGCCCAAGAGGCCCTGGTCCTTGGAGTGGCCCAAGAG
EST: TCCTGGTTTTGGTGGCCGGGGCCCGAGAGGTCCTGGTTTTGGCCCAAGAGGCCCTGGTCCTTGGAGTGGCCCAAGAG
genomic: TCCTGGTTTTGGTGGCCGGGGCCCGAGAGGTCCTGGTTTTGGCCCAAGAGGCCCTGGTCCTTGGAGTGGCCCAAGAG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTTTTGGTCCAGGAGGTCCTGGTTTTGGTGGCCGGGGCCCGAGAGGTCCTGGTTTTGGCCCAAGAGGCCCTGGTCCTTGGAGTGGCCCAAGAGgtcctcgtcctggtggaggaggaggccctggtcctggtccttggagtggcccaagag
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