Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGATTTTGGACTTGCCAAAATGTTGACTTCGGATGATCTTGCTTCCTCTgtgagacatgtgtaacctttgaattgaatttattcattgtaaatttaacacgacttgtaataatcaatgagtggttgtttgtaatgtag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G36690.2
intron # 7
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193587946|gb|FK541735.1|FK541735
EST:     TGATCTTGCTTCCTCT                         GTTGTGGGAACTCCTAGCTACATGTGCCCTGAGCTCCTTGCTGATATACCT
genomic: TGATCTTGCTTCCTCTgtgagacatg ... tgtaatgtagGTTGTGGGAACTCCTAGCTACATGTGCCCTGAGCTCCTTGCTGATATACCT
EST: gi|193553278|gb|FK509957.1|FK509957
EST:     GTGATTTTGGACTTGCCAAAATGTTGACTTCGGATGATCTTGCTTCCTCT                         GTTGTGGGAACTCCTAGCTACATGTGCCCTGAGCTCCTTGCTGATATACCT
genomic: GTGATTTTGGACTTGCCAAAATGTTGACTTCGGATGATCTTGCTTCCTCTgtgagacatg ... tgtaatgtagGTTGTGGGAACTCCTAGCTACATGTGCCCTGAGCTCCTTGCTGATATACCT