1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' |
gtaaattttcaagcactaagccatacctattggtgagacgttaattgatttcttaacgcattggttctttttttattgattagTGCAACAGCTCAGAGTGTGCAGACTATGATTGTGGGACGTCTGCTCGCTGGAATTGGAATTGGAATCTCATCAGCGATTGTACCACTTTACATATCTGAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT5G16150.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTTTTCAATTGGATGCTATCCCGCTTGTCCATTGGAGCTTTCTTATG TGCAACAGCTCAGAGTGTGCAGACTATGATTGTGGGACGTEST: gi|125254995|gb|EL269080.1|EL269080
genomic: CTTTTCAATTGGATGCTATCCCGCTTG-CCATTGGAGCTTTCTTATGgtaaattttc ... tattgattagTGCAACAGCTCAGAGTGTGCAGACTATGATTGTGGGACGT
EST: AGAACTTTTCAATTGGATGCTATCCCGCTTGCCATTGGAGCTTTCTTATG TGCAACAGCTCAGAGTGTGCAGACEST: gi|125276768|gb|EL290853.1|EL290853
genomic: AGAACTTTTCAATTGGATGCTATCCCGCTTGCCATTGGAGCTTTCTTATGgtaaattttc ... tattgattagTGCAACAGCTCAGAGTGTGCAGAC
EST: GATGCTATCCCGCTTGCCATTGGAGCTTTCTTATG TGCAACAGCTCAGAGTGTGCAGACTATGATTGTGGGACGTCTGCTCG
genomic: GATGCTATCCCGCTTGCCATTGGAGCTTTCTTATGgtaaattttc ... tattgattagTGCAACAGCTCAGAGTGTGCAGACTATGATTGTGGGACGTCTGCTCG
attggtgagacgttaattgatttcttaacgcattggttctttttttattgattagTGCAACAGCTCAGAGTGTGCAGACTATGATTGTGGGACGTCTGCTCGCTGGAATTGGAATTGGAATCTCATCAGCGATTGTACCACTTTACATATCTGAG
tcttaac putative branch site (score: 2)
ttctttttttatt putative PPT
ttctttttttattgat TA-rich tract