1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
ATCACGATATTGCAGGACAACATCGACAAGCCGTTCAATATCATCTGCAGCCCAAGTTCGATGCAGGAGTTCGGCATGGGGTGAAGATGGCTGCTATTTTgtaagtgagttggtggatgaaaattcaagttattgtagaagacaacacatttctttgcatattacatcctgctatgatgttctgaactatgatgggttca...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM5G897073_T05 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CCCAAGTTCGATGCAGGAGTTCGGCATGGGGTGAAGATGGCTGCTATTTT GTTGACATGGAAGAAATGGTGGCAGCACCAGCTTAGTATGGACAACAACTGEST: gi|6827943|gb|AW331586.1|AW331586
genomic: CCCAAGTTCGATGCAGGAGTTCGGCATGGGGTGAAGATGGCTGCTATTTTgtaagtgagt ... tttatattagGTTGACATGGAAGAAATGGTGGCAGCACCAGCTTAGTATGGACAACAACTG
EST: GTGAAGATGGCTGCTATTTT GTTGGCATGGAAGAAATGGTGGCAGCACCAGCTTAGTATGGACANCAACTGEST: gi|6865278|gb|AW360628.1|AW360628
genomic: GTGAAGATGGCTGCTATTTTgtaagtgagt ... tttatattagGTTGACATGGAAGAAATGGTGGCAGCACCAGCTTAGTATGGACAACAACTG
EST: AAGTTCGATGCAGGAGTTCGGCATGGGGTGAAGATGGCTGCTATTTT GTTGACATGNAAGAAATGGTGCCAGCNCCAGCTTAGTATGGACAACAACTGEST: gi|60348829|gb|DN215802.1|DN215802
genomic: AAGTTCGATGCAGGAGTTCGGCATGGGGTGAAGATGGCTGCTATTTTgtaagtgagt ... tttatattagGTTGACATGGAAGAAATGGTGGCAGCACCAGCTTAGTATGGACAACAACTG
EST: CCCAAGTTCGATGCAGGAGTTCGGCATGGGGTGAAGATGGCTGCTATTTT GTTGACATGGAAGAAATGGTGGCAGCACCAGCTTAGTATGGACAACAACTGEST: gi|60349066|gb|DN216039.1|DN216039
genomic: CCCAAGTTCGATGCAGGAGTTCGGCATGGGGTGAAGATGGCTGCTATTTTgtaagtgagt ... tttatattagGTTGACATGGAAGAAATGGTGGCAGCACCAGCTTAGTATGGACAACAACTG
EST: CCCAAGTTCGATGCAGGAGTTCGGCATGGGGTGAAGATGGCTGCTATTTT GTTGACATGGAAGAAATGGTGGCAGCACCAGCTTAGTATGGACAACAACTG
genomic: CCCAAGTTCGATGCAGGAGTTCGGCATGGGGTGAAGATGGCTGCTATTTTgtaagtgagt ... tttatattagGTTGACATGGAAGAAATGGTGGCAGCACCAGCTTAGTATGGACAACAACTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATCACGATATTGCAGGACAACATCGACAAGCCGTTCAATATCATCTGCAGCCCAAGTTCGATGCAGGAGTTCGGCATGGGGTGAAGATGGCTGCTATTTTgtaagtgagttggtggatgaaaattcaagttattgtagaagacaacacatttctttgcatattacatcctgctatgatgttctgaactatgatgggttca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT