Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtttgtttgagacatggacaatgttgtttcattatatcaatggattctgcttctctaaagaaccacatgaagtagcttgtatgtttgcctctttgatttatttacatgcaatctttacagGGAAGGATACTCATGGAGATGAACTATATGCTTGCTTATGGTTCAACTGAAGCTTCTTTGTGGTTGTTGTGGCGGTTTGTCCACCTTGAACATTTGTTGC

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G448054_T02
intron # 6
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

catgaagtagcttgtatgtttgcctctttgatttatttacatgcaatctttacagGGAAGGATACTCATGGAGATGAACTATATGCTTGCTTATGGTTCAACTGAAGCTTCTTTGTGGTTGTTGTGGCGGTTTGTCCACCTTGAACATTTGTTGC
                         ctttgat  putative branch site (score: 5)
                                              tctttac  putative PPT
                          tttgatttatttacat  TA-rich tract