1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtaccaactattttgactcgactttacttatttcccccccttaaagtatggtctacccaagattgaagccaccatttccatcctctaatccctgtcatttttattctctcctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACTATTCTGTTGAGACTGTCACT
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G112793_T01 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|22490124|gb|BU050047.1|BU050047
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|211046221|gb|FL204514.1|FL204514
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAACTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|211043271|gb|FL204511.1|FL204511
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|211046223|gb|FL204516.1|FL204516
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|211046224|gb|FL204517.1|FL204517
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGNGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|211043272|gb|FL204512.1|FL204512
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACVAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|78118757|gb|DV537141.1|DV537141
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|26559743|gb|CA831978.1|CA831978
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|211043270|gb|FL204510.1|FL204510
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|211046225|gb|FL204518.1|FL204518
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|18655213|gb|BM500018.1|BM500018
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|6021718|gb|AW066646.1|AW066646
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|31360213|gb|CD444570.1|CD444570
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|211043273|gb|FL204513.1|FL204513
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACAAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|87153205|gb|DY397994.1|DY397994
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|22541924|gb|BU092362.1|BU092362
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|211046226|gb|FL204519.1|FL204519
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACEST: gi|166424004|gb|EG058631.1|EG058631
genomic: TACATGGACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
EST: GACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAG TGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
genomic: GACAATTCCATGATCTTGTAGAGCTTTTCCGAATTGGTGGGAAGgtaccaacta ... ctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTAC
aagccaccatttccatcctctaatccctgtcatttttattctctcctgtttccagTGTCCAGACACCAATTACTTATTTATGGGGGATTATGTAGATCGTGGCTACTATTCTGTTGAGACTGTCACT
ctctaat putative branch site (score: 152)
tccctgtcatttttat CT-rich tract
tcatttttatt TA-rich tract