Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtacgatggacaacatagcaagactgtggaatctatctttaaatgcttcaagattatcttgaatagtataaactcaatgggtatgtgcacttttagtaatattacttttgttttggcggttatgttatttatggtctacttgagtgtttgtggttcaatctttcttagGACTACAATCATTGTCTTGCTCAACCTTGTACATGATGGCTGGATACTAGAAACAGATCCCAGTGCCCCCACCACCTTCCGTTCATTATCCTTGTTCTTC

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G110924_T02
intron # 6
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tggcggttatgttatttatggtctacttgagtgtttgtggttcaatctttcttagGACTACAATCATTGTCTTGCTCAACCTTGTACATGATGGCTGGATACTAGAAACAGATCCCAGTGCCCCCACCACCTTCCGTTCATTATCCTTGTTCTTC
                                             tctttctt  CT-rich tract
      ttatgttatttat  TA-rich tract