1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtaagtttcttcaatatttatctctgttcatttattttgatgatctcttgtatatacatgctgcaacttattcatcaatcagcagcattatatgtttttttgggttcaattcaaggatttcattataagaatttcttctaaacagaattgagtttgggatgaccaagatttatcctctggcttatgatagGTTACTAAAGTTATGGCTAGAATGGCCTCAGCTGATATAATGTGTGTTGGCCCCAAGTCTGTGCGAGAAAAATTTACTGGAATAATTAG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv04s0043g00400.t01 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATAGTGCCCATGGTGCCATTCCTGAGCCTGGTTCCATTGTCATTGCCAGG GTTACTAAAGCTATGGCTAGAATGGCCTCAGCTGATATAATGTGTGTTGGCEST: gi|349828307|gb|FQ416260.1|FQ416260
genomic: ATAGTGCCCATGGTGCCATTCCTGAGCCTGGTTCCATTGTCATTGCCAGGgtaagtttct ... cttatgatagGTTACTAAAGTTATGGCTAGAATGGCCTCAGCTGATATAATGTGTGTTGGC
EST: ATAGTGCCCATGGTGCCATTCCTGAGCCTGGTTCCATTGTCATTGCCAGG GTTACTAAAGTTATGGCTAGAATGGCCTCAGCTGATATAATGTGTGTTGGCEST: gi|349821758|gb|FQ408196.1|FQ408196
genomic: ATAGTGCCCATGGTGCCATTCCTGAGCCTGGTTCCATTGTCATTGCCAGGgtaagtttct ... cttatgatagGTTACTAAAGTTATGGCTAGAATGGCCTCAGCTGATATAATGTGTGTTGGC
EST: ATAGTGCCCATGGTGCCATTCCTGACCCTGGTTCCATTGTCATTGCCGGG GTTACTAACGTTATGGCTAGAATGGCCTCACCTGATATAATGTGTGTTGGCEST: gi|349827092|gb|FQ421365.1|FQ421365
genomic: ATAGTGCCCATGGTGCCATTCCTGAGCCTGGTTCCATTGTCATTGCCAGGgtaagtttct ... cttatgatagGTTACTAAAGTTATGGCTAGAATGGCCTCAGCTGATATAATGTGTGTTGGC
EST: ATAGTGCCCATGGTGCCATTCCTGAGCCTGGTTCCATTGTCATTGCCAGG GTTACTAAAGTTATGGCTAGAATGGCCTCAGCTGTTATAATGTGTGTTGGCEST: gi|110419251|gb|EC985464.1|EC985464
genomic: ATAGTGCCCATGGTGCCATTCCTGAGCCTGGTTCCATTGTCATTGCCAGGgtaagtttct ... cttatgatagGTTACTAAAGTTATGGCTAGAATGGCCTCAGCTGATATAATGTGTGTTGGC
EST: ATAGTGCCCATGGTGCCATTCCTGAGCCTGGTTCCATTGTCATTGCCAGG GTTACTAAAGTTATGGCTAGAATGGCCTCAGCTGATATAATGTGTGTTGGC
genomic: ATAGTGCCCATGGTGCCATTCCTGAGCCTGGTTCCATTGTCATTGCCAGGgtaagtttct ... cttatgatagGTTACTAAAGTTATGGCTAGAATGGCCTCAGCTGATATAATGTGTGTTGGC
ttctaaacagaattgagtttgggatgaccaagatttatcctctggcttatgatagGTTACTAAAGTTATGGCTAGAATGGCCTCAGCTGATATAATGTGTGTTGGCCCCAAGTCTGTGCGAGAAAAATTTACTGGAATAATTAG
ttctaaa putative branch site (score: 2)
aagatttat TA-rich tract