1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...gaactcattcgctgttaattttaggtcgttgtttacatgaagtgtttatctattaaatgcagattgccattttatatgaataactttgagttgtttgcagGTAGAGCACTGGGGGTTATGGTGGTTACCGTCTTTTATCAATCACTCATGTCTTCCTAGCTCTTCTCCTATGCTCGTTGGAAAAGCTCTTTTTGTATTTG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S98_145V6.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCACGATGGGATGGAAAAATTTACCTGGCTCTGGCGATCAAGCTCAGAAG GTAGAGCACTGGGGGTTATGGTGGTTACCGTCTTTTATCAATCACTCATGTEST: gi|162231014|gb|FC407269.1|FC407269
genomic: CCACGATGGGATGGAAAAATTTACCTGGCTCTGGCGATCAAGCTCAGAAGgtatgtctgg ... ttgtttgcagGTAGAGCACTGGGGGTTATGGTGGTTACCGTCTTTTATCAATCACTCATGT
EST: CCACGATGGGATGGAAAAATTTACCTGGCTCTGGCGATCAAGCTCAGAAG GTAGAGCACTGGGGGTTATGGTGGTTACCGTCTTTTATCAATCACTCATGTEST: gi|162193502|gb|FC370405.1|FC370405
genomic: CCACGATGGGATGGAAAAATTTACCTGGCTCTGGCGATCAAGCTCAGAAGgtatgtctgg ... ttgtttgcagGTAGAGCACTGGGGGTTATGGTGGTTACCGTCTTTTATCAATCACTCATGT
EST: CCACGATGGGATGGAAAAATTTACCTGGCTCTGGCGATCAAGCTCAGAAG GTAGAGCACTGGGGGTTATGGTGGTTACCGTCTTTTATCAATCACTCATGT
genomic: CCACGATGGGATGGAAAAATTTACCTGGCTCTGGCGATCAAGCTCAGAAGgtatgtctgg ... ttgtttgcagGTAGAGCACTGGGGGTTATGGTGGTTACCGTCTTTTATCAATCACTCATGT
ttatctattaaatgcagattgccattttatatgaataactttgagttgtttgcagGTAGAGCACTGGGGGTTATGGTGGTTACCGTCTTTTATCAATCACTCATGTCTTCCTAGCTCTTCTCCTATGCTCGTTGGAAAAGCTCTTTTTGTATTTG
gaataac putative branch site (score: 3)
attttatatgaataac TA-rich tract