1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtacactaagctttttacttgtttaatttaaatttatctttactgtgaattatgccaaaaaggtttatatctggatttttagattaatcttacggtttcttgaatgcagGATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACATGATCATGCAATCA
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S92_44V6.1 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAA GATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACAEST: gi|162267210|gb|FC442622.1|FC442622
genomic: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAAgtacactaag ... ttgaatgcagGATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACA
EST: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAA GATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACAEST: gi|208371902|gb|DC951866.1|DC951866
genomic: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAAgtacactaag ... ttgaatgcagGATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACA
EST: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAA GATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACAEST: gi|208397261|gb|DC920615.1|DC920615
genomic: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAAgtacactaag ... ttgaatgcagGATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACA
EST: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAA GATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACAEST: gi|162268964|gb|FC445456.1|FC445456
genomic: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAAgtacactaag ... ttgaatgcagGATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACA
EST: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAA GATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACAEST: gi|162271607|gb|FC447492.1|FC447492
genomic: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAAgtacactaag ... ttgaatgcagGATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACA
EST: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAA GATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACAEST: gi|162261907|gb|FC437311.1|FC437311
genomic: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAAgtacactaag ... ttgaatgcagGATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACA
EST: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAA GATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACAEST: gi|162261908|gb|FC437312.1|FC437312
genomic: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAAgtacactaag ... ttgaatgcagGATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACA
EST: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAA GATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACA
genomic: GCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAAgtacactaag ... ttgaatgcagGATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACA
ccaaaaaggtttatatctggatttttagattaatcttacggtttcttgaatgcagGATTTCACAAGAACAAGGGATGCCACAGGTGCTGTAGGCTACTTGGAAACATGATCATGCAATCA
atcttac putative branch site (score: 79)
tttctt putative PPT
atttttagattaatct TA-rich tract