1 5' 3' | 2 5' 3' |
...tcgtgttgttttagggacactggctcagtcctttgtcgttgccgagaagtttgattattcataataacaataattaatcacagtttttctctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGTTTGCCATGAGACACGGCCGCAAAATTCACCGCCTCGGAAGGCCTGCCGA
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S91_15V6.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTG GAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGTEST: gi|67698575|gb|BJ958808.1|BJ958808
genomic: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTGgtaagtctta ... ctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGT
EST: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTG GAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGTEST: gi|67572128|gb|BJ944952.1|BJ944952
genomic: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTGgtaagtctta ... ctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGT
EST: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTG GAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGTEST: gi|162227947|gb|FC404580.1|FC404580
genomic: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTGgtaagtctta ... ctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGT
EST: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTG GAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGTEST: gi|67694795|gb|BJ955028.1|BJ955028
genomic: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTGgtaagtctta ... ctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGT
EST: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTG GAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGTEST: gi|18363085|gb|BJ195157.1|BJ195157
genomic: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTGgtaagtctta ... ctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGT
EST: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTG GAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGTEST: gi|162227946|gb|FC404579.1|FC404579
genomic: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTGgtaagtctta ... ctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGT
EST: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTG GAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGTEST: gi|67695495|gb|BJ955728.1|BJ955728
genomic: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTGgtaagtctta ... ctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGT
EST: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTG GAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGTEST: gi|37840299|gb|BJ598307.1|BJ598307
genomic: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTGgtaagtctta ... ctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGT
EST: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTG GAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGTEST: gi|67575120|gb|BJ947944.1|BJ947944
genomic: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTGgtaagtctta ... ctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGT
EST: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTG GAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGTEST: gi|67571460|gb|BJ944284.1|BJ944284
genomic: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTGgtaagtctta ... ctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGT
EST: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTG GAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGT
genomic: CCAGGCGTTCGATGGCCTCAGGAATGAGAATGCGCTGCAATTGCGTACTGgtaagtctta ... ctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGT
gaagtttgattattcataataacaataattaatcacagtttttctctttctgtagGAGCCACTTTTGGGGTGATGGGTTTAGGAATCAGCAATGGTGCGAAGTGGTTTGCCATGAGACACGGCCGCAAAATTCACCGCCTCGGAAGGCCTGCCGA
tttttctctttctgt CT-rich tract
attattcataataaca TA-rich tract