1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...aggcttatcagattgcagtacttcttggatgacgctacttttctattgctttttgcggggcaaatcgtctccaaattcacaaacttggtttgattatcagGTGAAGAGGATTCAGAATTTGGTGGAAACAATTGATGGATTACGAGGTTTGAGAATGGAGCCTAATCCTCCTGCCACAAATCCCAATGTTATGGCTACAA
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S6_195V6.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGGATGGTGTTGAGGCAGATGGAGATGCCAAAGCAATGAGGAGGGCAGAG GTGAAGAGGATTCAGAATTTGGTGGAAACAATTGATGGATTACGAGGTTTGEST: gi|18338830|gb|BJ170855.1|BJ170855
genomic: TGGATGGTGTTGAGGCAGATGGAGATGCCAAAGCAATGAGGAGGGCAGAGgtatgcttta ... tgattatcagGTGAAGAGGATTCAGAATTTGGTGGAAACAATTGATGGATTACGAGGTTTG
EST: TGGATGGTGTTGAGGCAGATGGAGATGCCAAAGCAATGAGGAGGGCAGAG GTGAAGAGGATTCAGAATTTGGTGGAAACAATTGATGGATTACGAGGTTTGEST: gi|37847127|gb|BJ605135.1|BJ605135
genomic: TGGATGGTGTTGAGGCAGATGGAGATGCCAAAGCAATGAGGAGGGCAGAGgtatgcttta ... tgattatcagGTGAAGAGGATTCAGAATTTGGTGGAAACAATTGATGGATTACGAGGTTTG
EST: TGGATGGTGTTGAGGCAGATGGAGATGCCAAAGCAATGAGGAGGGCAGAG GTGAAGAGGATTCAGAATTTGGTGGAAACAATTGATGGATTACGAGGTTTGEST: gi|37847533|gb|BJ605541.1|BJ605541
genomic: TGGATGGTGTTGAGGCAGATGGAGATGCCAAAGCAATGAGGAGGGCAGAGgtatgcttta ... tgattatcagGTGAAGAGGATTCAGAATTTGGTGGAAACAATTGATGGATTACGAGGTTTG
EST: TGGATGGTGTTGAGGCAGATGGAGATGCCAAAGCAATGAGGAGGGCAGAG GTGAAGAGGATTCAGAATTTGGTGGAAACAATTGATGGATTACGAGGTTTG
genomic: TGGATGGTGTTGAGGCAGATGGAGATGCCAAAGCAATGAGGAGGGCAGAGgtatgcttta ... tgattatcagGTGAAGAGGATTCAGAATTTGGTGGAAACAATTGATGGATTACGAGGTTTG
ttgctttttgcggggcaaatcgtctccaaattcacaaacttggtttgattatcagGTGAAGAGGATTCAGAATTTGGTGGAAACAATTGATGGATTACGAGGTTTGAGAATGGAGCCTAATCCTCCTGCCACAAATCCCAATGTTATGGCTACAA
gtttgat putative branch site (score: 9)
tttgattat TA-rich tract