1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...cgtggggcctggtgcgactggtggcgggtcgaccttgattgttgattaattacggactaaggctggtatcggctaatgcattggaagtgtggtggtgcagCCGGAGTTATACAAAATTCCGACCTTTCGCAAGTTGCTTTGATTCCTCCGTCACGTCTGGGGCCGCCAGCAGGCCACCATGCGTATTCGGAAGCGGCCCC
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S62_186V6.3 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAGTAATTAGAGGCCCTTGAGGTGGATGTAAGTAATATAATCGATTCACG CCGGAGTTATACAAAATTCCGACCTTTCGCAAGTTGCTTTGATTCCTCCGTEST: gi|100444630|gb|BY982459.1|BY982459
genomic: CAGTAATTAGAGGCCCTTGAGGTGGATGTAAGTAATATAATCGATTCACGgtaagtgggt ... ggtggtgcagCCGGAGTTATACAAAATTCCGACCTTTCGCAAGTTGCTTTGATTCCTCCGT
EST: ATAATCGATTCACG CCGGAGTTATACAAAATTCCGACCTTTCGCAAGTTGCTTTGATTCCTCCGT
genomic: ATAATCGATTCACGgtaagtgggt ... ggtggtgcagCCGGAGTTATACAAAATTCCGACCTTTCGCAAGTTGCTTTGATTCCTCCGT
ttaattacggactaaggctggtatcggctaatgcattggaagtgtggtggtgcagCCGGAGTTATACAAAATTCCGACCTTTCGCAAGTTGCTTTGATTCCTCCGTCACGTCTGGGGCCGCCAGCAGGCCACCATGCGTATTCGGAAGCGGCCCC
ggctaat putative branch site (score: 3)