1 5' 3' | 2 5' 3' |
...tgagttctggatgttgactcatgtgattgtttgcttcattctcttgaattgatggttgttgtgtggaaatcttgagtattctattgtgccgatcgtgcagGTTGGGTGAGAAGCCTTCGACGTTATCGAAAATGGACGTGGCAGCTTCGGTAGCTGGTCAGACCCAGTTCACGGTTGACTTGTACAAAACCTTGGTTAAG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S61_265V6.2 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGAGAGGCTGCGCCATGTAACTCAGTCTCTGGATCTGCGAGATACAATTG GTTGGGTGAGAAGCCTTCGACGTTATCGAAAATGGACGTGGCAGCTTCGGT
genomic: TGAGAGGCTGCGCCATGTAACTCAGTCTCTGGATCTGCGAGATACAATTGgtgctcccca ... gatcgtgcagGTTGGGTGAGAAGCCTTCGACGTTATCGAAAATGGACGTGGCAGCTTCGGT
gaattgatggttgttgtgtggaaatcttgagtattctattgtgccgatcgtgcagGTTGGGTGAGAAGCCTTCGACGTTATCGAAAATGGACGTGGCAGCTTCGGTAGCTGGTCAGACCCAGTTCACGGTTGACTTGTACAAAACCTTGGTTAAG
aattgat putative branch site (score: 4)
tattctatt TA-rich tract