Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatttatttgtggatgtcacttttctggcactaaactgaagggggttttcgtgcggcttttgcgtaacatgagcttgatgttctcctgagttccgaaatattctcagctttcgtgattttggctttttaattgttgtctaagaaatatggcgttcttcttgataatgcagGTTGTTGACGATGCCATCAGTGCGGGTATCGATGGCTATGATGCTGAGATGAAGTCTGCTGTAAGGGATGCAGCCACTGGCCTACGTCTCACACAAAAGG

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S509_22V6.2
intron # 11
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

attttggctttttaattgttgtctaagaaatatggcgttcttcttgataatgcagGTTGTTGACGATGCCATCAGTGCGGGTATCGATGGCTATGATGCTGAGATGAAGTCTGCTGTAAGGGATGCAGCCACTGGCCTACGTCTCACACAAAAGG
                                     ttcttcttg  CT-rich tract
        tttttaattgttgt  TA-rich tract