1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
...aaagtacagtgcgcttgttttggaatgtttgagaaagagaggtgttttcttctgaagagtttagtcttggtgtgctgattctcgtgagttgtgctaacagGATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGCGAGCACAGCAGCCATGAACTGGGCGCTAGCTCCCAGCCGTTCATACGGT
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S4_62V6.2 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTTACGATTGGTAATGCTGTATGGTGGGAGTGTCAGCATAGAGGGGAAAG GATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGCEST: gi|162191494|gb|FC367185.1|FC367185
genomic: GTTACGATTGGTAATGCTGTATGGTGGGAGTGTCAGCATAGAGGGGAAAGgtaagcatcg ... gtgctaacagGATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGC
EST: GTTACGATTGGTAATGCTGTATGGTGGGAGTGTCAGCATAGAGGGGAAAG GATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGCEST: gi|162224069|gb|FC400635.1|FC400635
genomic: GTTACGATTGGTAATGCTGTATGGTGGGAGTGTCAGCATAGAGGGGAAAGgtaagcatcg ... gtgctaacagGATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGC
EST: GTTACGATTGGTAATGCTGTATGGTGGGAGTGTCAGCATAGAGGGGAAAG GATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGCEST: gi|162192881|gb|FC369875.1|FC369875
genomic: GTTACGATTGGTAATGCTGTATGGTGGGAGTGTCAGCATAGAGGGGAAAGgtaagcatcg ... gtgctaacagGATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGC
EST: GTTACGATTGGTAATGCTGTATGGTGGGAGTGTCAGCATAGAGGGGAAAG GATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGCEST: gi|162161404|gb|FC337610.1|FC337610
genomic: GTTACGATTGGTAATGCTGTATGGTGGGAGTGTCAGCATAGAGGGGAAAGgtaagcatcg ... gtgctaacagGATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGC
EST: GTTACGATTGGTAATGCTGTATGGTGGGAGTGTCAGCATAGAGGGGAAAG GATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGCEST: gi|100382413|gb|BY969102.1|BY969102
genomic: GTTACGATTGGTAATGCTGTATGGTGGGAGTGTCAGCATAGAGGGGAAAGgtaagcatcg ... gtgctaacagGATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGC
EST: GTTACGATTGGTAATGCTGTATGGTGGGAGTGTCAGCATAGAGGGGAAAG GATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGC
genomic: GTTACGATTGGTAATGCTGTATGGTGGGAGTGTCAGCATAGAGGGGAAAGgtaagcatcg ... gtgctaacagGATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGC
tttcttctgaagagtttagtcttggtgtgctgattctcgtgagttgtgctaacagGATAAAACAAGAATGGGACGTAGTTGCTGTGAATGTATTGACTTTGGTTGCGAGCACAGCAGCCATGAACTGGGCGCTAGCTCCCAGCCGTTCATACGGT
tgctgat putative branch site (score: 50)