Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCTCTCTTTTCCGCGCGCATTCTGTTGGCCTTCGCCTCTCGCATCGGCGTCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttatctgctgcggcgtccgcttttctgcccttgctcatactccttgaatgcccgtttagttaactgctgccgtcgttaggtttcaggaattttaaactttaggtttaggttgttgttggtggctatgttcgttggttcagttcactcgaattgcgtttgaagtttttggacttgtatgcag

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S39_130V6.1
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208359494|gb|DC954047.1|DC954047
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|22133100|gb|BQ827545.1|BQ827545
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18329090|gb|BJ161096.1|BJ161096
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162251500|gb|FC425568.1|FC425568
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162257842|gb|FC434040.1|FC434040
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18346495|gb|BJ178539.1|BJ178539
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|7047321|gb|AW477215.1|AW477215
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18331602|gb|BJ163613.1|BJ163613
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67718574|gb|BJ968833.1|BJ968833
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67694411|gb|BJ954644.1|BJ954644
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|7147701|gb|AW509672.1|AW509672
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162226813|gb|FC403833.1|FC403833
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162220214|gb|FC395452.1|FC395452
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162216545|gb|FC392442.1|FC392442
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|19789090|gb|BQ041086.1|BQ041086
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162207481|gb|FC383726.1|FC383726
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67573655|gb|BJ946479.1|BJ946479
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18350783|gb|BJ182834.1|BJ182834
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18334605|gb|BJ166622.1|BJ166622
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162208654|gb|FC385051.1|FC385051
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162216546|gb|FC392443.1|FC392443
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162277647|gb|FC453278.1|FC453278
EST:     TTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162213744|gb|FC390359.1|FC390359
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162223409|gb|FC400612.1|FC400612
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162206049|gb|FC382834.1|FC382834
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162273540|gb|FC449685.1|FC449685
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18365642|gb|BJ197719.1|BJ197719
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162250659|gb|FC428250.1|FC428250
EST:     CTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: CTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|208348509|gb|DC901972.1|DC901972
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|208396507|gb|DC915819.1|DC915819
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|37844499|gb|BJ602507.1|BJ602507
EST:     CAGCCCGCAACCTTGGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: CAGCCCGCAACCTT-GAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|19789335|gb|BQ041247.1|BQ041247
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67726057|gb|BJ976316.1|BJ976316
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162221403|gb|FC398551.1|FC398551
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|15326964|gb|BI487412.1|BI487412
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67699675|gb|BJ959908.1|BJ959908
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162243737|gb|FC419570.1|FC419570
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67699985|gb|BJ960218.1|BJ960218
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18332530|gb|BJ164543.1|BJ164543
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162242066|gb|FC415799.1|FC415799
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162249755|gb|FC425621.1|FC425621
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18373991|gb|BJ205569.1|BJ205569
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162241644|gb|FC414714.1|FC414714
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|37845765|gb|BJ603773.1|BJ603773
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67716818|gb|BJ967077.1|BJ967077
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162241074|gb|FC417732.1|FC417732
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162275050|gb|FC450909.1|FC450909
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162221402|gb|FC398550.1|FC398550
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162224521|gb|FC399897.1|FC399897
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18343554|gb|BJ175592.1|BJ175592
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|19777591|gb|BQ039200.1|BQ039200
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162261931|gb|FC437322.1|FC437322
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162213743|gb|FC390358.1|FC390358
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162258894|gb|FC434901.1|FC434901
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162277488|gb|FC453431.1|FC453431
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162240094|gb|FC414906.1|FC414906
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|37825605|gb|BJ583671.1|BJ583671
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67717542|gb|BJ967801.1|BJ967801
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|19789400|gb|BQ041287.1|BQ041287
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162277648|gb|FC453279.1|FC453279
EST:     TTCACCATGGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TTCACCAT-GGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18345466|gb|BJ177509.1|BJ177509
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGTGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162278156|gb|FC454391.1|FC454391
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67576177|gb|BJ949001.1|BJ949001
EST:     TCNGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18338127|gb|BJ170151.1|BJ170151
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162206048|gb|FC382833.1|FC382833
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162203844|gb|FC379941.1|FC379941
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162256845|gb|FC432947.1|FC432947
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162224522|gb|FC399898.1|FC399898
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162260676|gb|FC436680.1|FC436680
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67725336|gb|BJ975595.1|BJ975595
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|37830110|gb|BJ588122.1|BJ588122
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67571097|gb|BJ943921.1|BJ943921
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162210992|gb|FC387298.1|FC387298
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162259175|gb|FC435208.1|FC435208
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67703385|gb|BJ963618.1|BJ963618
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162243736|gb|FC419569.1|FC419569
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|22132980|gb|BQ827468.1|BQ827468
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162256846|gb|FC432948.1|FC432948
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162261932|gb|FC437323.1|FC437323
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|7287001|gb|AW599488.1|AW599488
EST:     GCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCGGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: GCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67723613|gb|BJ973872.1|BJ973872
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162210601|gb|FC386289.1|FC386289
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67697041|gb|BJ957274.1|BJ957274
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|208373421|gb|DC941046.1|DC941046
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162250660|gb|FC428251.1|FC428251
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67576461|gb|BJ949285.1|BJ949285
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67719812|gb|BJ970071.1|BJ970071
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162207480|gb|FC383725.1|FC383725
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67709540|gb|BJ965356.1|BJ965356
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162275049|gb|FC450908.1|FC450908
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18375486|gb|BJ207064.1|BJ207064
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|18326618|gb|BJ158617.1|BJ158617
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67728074|gb|BJ978333.1|BJ978333
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162249754|gb|FC425620.1|FC425620
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|19782925|gb|BQ039937.1|BQ039937
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|67703021|gb|BJ963254.1|BJ963254
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|37822754|gb|BJ580820.1|BJ580820
EST:     GTATGCACAGTTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGT
genomic: GTATGCACAG-TTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGT
EST: gi|18335091|gb|BJ167109.1|BJ167109
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|37824519|gb|BJ582585.1|BJ582585
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGTGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
EST: gi|162258893|gb|FC434900.1|FC434900
EST:     TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGG                         GAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG
genomic: TCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 35 (upstream exon), 35 (downstream exon)
Score: 197

GCTCTCTTTTCCGCGCGCATTCTGTTGGCCTTCGCCTCTCGCATCGGCGTCAGCCCGCAACCTTGAGTCTTTCACCATGGGGCGTATGCACAGTTCCGGgtacgtttat ... ttgtatgcagGAAGGGTATGTCCTCATCGGCTTTGCCGTACAAGAGGAGCCCGCCATCGTGGTTGAAGATCACCACCGCCGAGGTTGAAGAGCATATCTGCAAGCTCGCC




<











<


<