1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...tcttctcataattctcgaacatagggaagtctgaattcaattatggccgttgacaccttaccagacgttgctcacccttttggtggtactggatgaacagCGCGGATGTTGTCTTTTTTGTCGGTGGATCTGTATGGACGTTGGACTGGTGTCCTCGTAGACCCGGATGGTCGTCTCAGGTCATTCAGAATGAG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S397_28V6.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCTTCAAGTGGTTCCAAAAATGGCGCTGGAATGAAAAGTACATG CGCGGATGTTGTCTTTTTTGTCGGTGGATCTGTATGGACGTTGGACTGGTGEST: gi|18325655|gb|BJ157652.1|BJ157652
genomic: CCTTCAAGTGGTTCCAAAAATGGCGCTGGAATGAAAAGTACATGgtcagtttct ... ggatgaacagCGCGGATGTTGTCTTTTTTGTCGGTGGATCTGTATGGACGTTGGACTGGTG
EST: CCTTCAAGTGGTTCCAAAAATGGCGCTGGAATGAAAAGTACATG CGCGGATGTTGTCNNNNNNNGTCGGTGGATCTGTATGGACGTTGGACTGGT
genomic: CCTTCAAGTGGTTCCAAAAATGGCGCTGGAATGAAAAGTACATGgtcagtttct ... ggatgaacagCGCGGATGTTGTCTTTTTT-GTCGGTGGATCTGTATGGACGTTGGACTGGT
gccgttgacaccttaccagacgttgctcacccttttggtggtactggatgaacagCGCGGATGTTGTCTTTTTTGTCGGTGGATCTGTATGGACGTTGGACTGGTGTCCTCGTAGACCCGGATGGTCGTCTCAGGTCATTCAGAATGAG
tgctcac putative branch site (score: 1)