1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtacaagtcatttcgagtgatttggtagcttgtggtcctaatgttaactggttttgtacgagtccatgctcgtggttttctttgaattatagcgcatacgttaggctgtaatggtgtgaccgaaaggtccttatcataataattataatagtaatagtaagggtttgatgttgtttgacagGTAACTCCTTATTACGATTTTGTGAACTCGATCGATTCAGATGAAGAGCTCGACTTGGGCTCTGGTTCAGGGTCAGAAGGGTCATGCGGCAGTGGCAGCG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S206_15V6.1 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTTCCACGCCTCANNNNNNNGAGTTTGAAGCTGTTCAACCTCGTCCTAAG GTAACTCCTTATTACGATTTTGTGAACTCGATCGATTCAGATGAAGAGCTCEST: gi|37827316|gb|BJ585328.1|BJ585328
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EST: TTTCCACGCCTCANNNNNNNGAGTTTGAAGCTGTTCAACCTCGTCCTAAG GTAACTCCTTATTACGATTTTGTGAACTCGATCGATTCAGATGAAGAGCTCEST: gi|37825057|gb|BJ583123.1|BJ583123
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EST: TTTCCACGCCTCANNNNNNNGAGTTTGAAGCTGTTCAACCTCGTCCTAAG GTAACTCCTTATTACGATTTTGTGAACTCGATCGATTCAGATGAAGAGCTCEST: gi|37828979|gb|BJ586991.1|BJ586991
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gtccttatcataataattataatagtaatagtaagggtttgatgttgtttgacagGTAACTCCTTATTACGATTTTGTGAACTCGATCGATTCAGATGAAGAGCTCGACTTGGGCTCTGGTTCAGGGTCAGAAGGGTCATGCGGCAGTGGCAGCG
gtttgat putative branch site (score: 5)
tatcataataattata TA-rich tract