1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gttaggttctttctactgtatatatatgctttaaacgatatggaaatatcccctgtatttgtggtgccttctgtttcaggtttatgtttgctaacaatctttttctgttgcgcagCTCTGGTCACCTTTATTGGTGACCGTCCCTTTCTACCCTTTCTTCTATTTCTCGGTCAAGGCCTTTGTCTTCTGTGGGTATCTTTCTTGCGTGGCATCTT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g29390.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTTGATTGATTTTGCCAAGGAATGTTCGGGCTGCTGGTTCAATCAAGCAG CTCTGGTCACCTTTATTGGTGACTGTCCCTTTCTACCCTTTCTTCTATTTC
genomic: CTTGATTGATTTTGCCAAGGAATGTTCGGGCTGCTGGTTCAATCAAGCAGgttaggttct ... tgttgcgcagCTCTGGTCACCTTTATTGGTGACCGTCCCTTTCTACCCTTTCTTCTATTTC
gtggtgccttctgtttcaggtttatgtttgctaacaatctttttctgttgcgcagCTCTGGTCACCTTTATTGGTGACCGTCCCTTTCTACCCTTTCTTCTATTTCTCGGTCAAGGCCTTTGTCTTCTGTGGGTATCTTTCTTGCGTGGCATCTT
tgctaac putative branch site (score: 16)
tctttttctgttgc putative PPT
tttatgttt TA-rich tract