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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AGGCTGATCTGCTGAATCAACTGAAGGACCTGAAGGCGGAGCTTGCCTTGCTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacctaatctaaataaatttttgtttgttttgcctatgaggtgtttgtgttaattacttattttgaaattggggtttgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G38480.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA20G38480.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os02g30050.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
AGGCTGATCTGCTGAATCAACTGAAGGACCTGAAGGCGGAGCTTGCCTTGCTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacctaatctaaataaatttttgtttgttttgcctatgaggtgtttgtgttaattacttattttgaaattggggttt-gcag
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AGGCGGAGCTGCAGGCCCAGCTCAAGGACCTCAAGGCGGAGCTCTCCCTCCTCCGCGTCGCCAAGGTCACCGGCGGCGCCCCCAACAAGCTCTCCAAGATgtacgcgcttcgcgctcgcg--ctcgcgctcattctctcctctttctgtgtgcccttgtgattgattgaatctctgtggttttgcag

upper sequence: GLYMA20G38480.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os04g30730.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
AGGCTGATCTGCTGAATCAACTGAAGGACCTGAAGGCGGAGCTTGCCTTGCTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacctaatctaaataaatttttgtttgttt-tgcctatgaggtgtttgtgttaattacttattttga-----aattggggtttgcag
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AGGCGGAGCTGCAGGCCCAGCTCAAGGACCTCAAGGCGGAGCTCTCCCTCCTCCGCGTCGCCAAGGTCACCGGCGGCGCCCCCAACAAGCTCTCCAAGATgtg-cgcctccttcctccttctctctcgctcgtttgttggtgtggctggatctcgctcacgggttcttggggtggtgaattttttttcgcag

upper sequence: GLYMA20G38480.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: AT3G55170.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 2
AGGCTGATCTGCTGAATCAACTGAAGGACCTGAAGGCGGAGCTTGCCTTGCTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataac---ctaatctaa----------ataaatttttgtttgttttgc-ctatgaggtgtttgtgttaattacttattttgaaattggggtttgcag-
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AATCGGATCTTTCTACTCAATTGAAAGAATTGAAGGCAGAGCTTGCTTCCCTACGTGTCGCTAAGGTCACTGGTGGTGCTCCTAACAAGCTCTCTAAGATgtaattgttctctactctcagccttattatacaaatgttggaatattttgagctgcttgatattggaatcactagcctctttctgagt-atgatctaaagc

upper sequence: GLYMA20G38480.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: AT2G39390.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 2
AGGCTGATCTGCTGAATCAACTGAAGGACCTGAAGGCGGAGCTTGCCTTGCTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacctaatctaaataaatttttgtttgttttgcctatgaggtgtttg-tgttaattacttattttgaaattggggtttgcag-------------
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AAGCTGATCTTTCGGGTCAGTTGAAGGAATTTAAGGCAGAGCTTGCTCTCCTTCGTGTCGCTAAGGTCACTGGAGGTGCTCCTAATAAGCTCTCTAAGATgtatgtgtttcctctatacacactttgtgtgatcaaatgttacatttttctgattttggttaactctttttttttttggattctgaattcttcatagctt

upper sequence: GLYMA20G38480.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: Vv06s0004g04020.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
AGGCTGATCTGCTGAATCAACTGAAGGACCTGAAGGCGGAGCTTGCCTTGCTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacctaatctaaataaatttttgtttgttttgcctatgaggtgtttgtgttaattacttattttgaaattggggtttgcag----------------
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AGGCCGATCTGTTGGCCCAATTGAAGGAGCTGAAAGCAGAGCTCGCTCTTCTCCGAGTCGCCAAGGTCACTGGTGGTGCTCCCAACAAGCTTTCTAAGATgtactactttctctctgttttatatttatatgtgtttatca--aattgactaaactgtttggttgctgagagaatctggaaaggaaaagaaattggtaagtg

upper sequence: GLYMA20G38480.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: Vv00s0317g00130.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 2
AGGCTGATCTGCTGAATCAACTGAAGGACCTGAAGGCGGAGCTTGCCTTGCTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacctaatctaaataaatttttgtttgttttgcctatgaggtgtttgtgttaattacttattttgaa-----attggggtttgcag-----------
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AGGCGGACTTGTTGGTGCAGTTGAAGGAGTTGAAGGCCGAACTTGCTCTTCTCCGAGTTGCCAAGGTCACCGGTGGTGCACCAAACAAGCTCTCCAAGATgtactctcttttcctct-tccatttatgtatatat-atctgtgttatatgtgtatttttcaagttttgttaagatttattggtgtttatgcggtttgttagg

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|5606134|gb|AI900232.1|AI900232
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|18039523|gb|BM307817.1|BM307817
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|254318392|gb|GR832560.1|GR832560
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|31472655|gb|CD414683.1|CD414683
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|151396919|gb|EV266792.1|EV266792
EST:     TTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|27427487|gb|CA939007.1|CA939007
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|41145394|gb|CK605605.1|CK605605
EST:     GCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: GCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|4437024|gb|AI522889.1|AI522889
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|31475415|gb|CD417443.1|CD417443
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|254329372|gb|GR833744.1|GR833744
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|7640442|gb|AW734744.1|AW734744
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|193435718|gb|FK401660.1|FK401660
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTG
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTG
EST: gi|6718736|gb|AW306383.1|AW306383
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|7030236|gb|AW460019.1|AW460019
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|21993570|gb|BQ785098.1|BQ785098
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|6724731|gb|AW309130.1|AW309130
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|7029893|gb|AW459676.1|AW459676
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|42723218|gb|CK769117.1|CK769117
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|58014494|gb|CX701236.1|CX701236
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|23729909|gb|BU763062.1|BU763062
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|4297362|gb|AI442607.1|AI442607
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|193673152|gb|FK619014.1|FK619014
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|6726390|gb|AW310744.1|AW310744
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|6718864|gb|AW306511.1|AW306511
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|23733284|gb|BU764823.1|BU764823
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|9203879|gb|BE330103.1|BE330103
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|19053062|gb|BM731729.1|BM731729
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|5606716|gb|AI900814.1|AI900814
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|17400104|gb|BM176886.1|BM176886
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|31309274|gb|CD394477.1|CD394477
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|207824241|gb|GD795028.1|GD795028
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|31306508|gb|CD391711.1|CD391711
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTTACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|7147304|gb|AW509226.1|AW509226
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|7284973|gb|AW597460.1|AW597460
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|14990784|gb|BI316457.1|BI316457
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCATAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
EST: gi|21285622|gb|BQ473493.1|BQ473493
EST:     CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGAT                         AAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
genomic: CTTCGTGTTGCTAAGGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAGATgtaataacct ... gggtttgcagAAAGGTGGTGAGGTTGAACATTGCCCAGGTTTTGACGGTGATTTCTCAGAA
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
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