1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...aagcttcatcagttaattatacccatatcgtaaccttatggagcaagacatatcatgcatgacattatagtgacaagtttttgtgcttgaaaatatgcagATAGGTGCAAGCTAGGATATGAGCAGCAGAATGAGTGGTACTTTTTCAGCCATAAAGATAAGAAGTATCCAACAGGGACAAGAACTAACAGGGCCACTGC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G31550.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
agacatatcatgcatgacattatagtgacaagtttttgtgcttgaaaatatgcagATAGGTGCAAGCTAGGATATGAGCAGCAGAATGAGTGGTACTTTTTCAGCCATAAAGATAAGAAGTATCCAACAGGGACAAGAACTAACAGGGCCACTGC
ttgaaaatat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| aagcttcatcagttaattatacccatatcgtaaccttatggagcaagacatatcatgcatgacattatagtgacaagtttttgtgcttgaaaatatgcagATAGGTGCAAGCTAGGATATGAGCAGCAGAATGAGTGGTACTTTTTCAGCCATAAAGATAAGAAGTATCCAACAGGGACAAGAACTAACAGGGCCACTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAAGT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAC
-agcttca
- - - - - - - - - - acccata
- - - - - - - - - - - - - - - - -ccttatg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -caagaca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gcatgac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgacaag