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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATCCCAGCAGGTTATCCAGTTGTGGTCAACGCTACCTCAAATCTGAATTTCTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatttatatatcacaatcaaatagaatattgttgttacttttttgttttattgcatgtgaaacatagccgcctgagttatttcaaacctaaacttggtgattgaaaacttgaag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G28650.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|6916435|gb|AW397965.1|AW397965
EST:     TTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAAGAACTTCCTCGCAAG                         GT-CGCAAGACAATGTGATGAAGCCAGATACCTAGTCAAGTTGCAGGAGC
genomic: TTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCA-Ggtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGAT-AAGCCAGATACCTAGTCAAGT-GCAGGAGC
EST: gi|298182060|gb|HO026235.1|HO026235
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|13787898|gb|BG650490.1|BG650490
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|6915314|gb|AW396844.1|AW396844
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|214007552|gb|DB986667.1|DB986667
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|5342762|gb|AI795046.1|AI795046
EST:     CTGTGCTATTGCTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTNCTCGCAT                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCATGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|11688589|gb|BF596265.1|BF596265
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|209727724|gb|BW658461.1|BW658461
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|213605260|gb|DB978734.1|DB978734
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|5126315|gb|AI748051.1|AI748051
EST:     ACCAGGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: ACCA-GAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|11688165|gb|BF595841.1|BF595841
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|13787248|gb|BG649840.1|BG649840
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|213600879|gb|DB980344.1|DB980344
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|213613545|gb|DB978636.1|DB978636
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|213605161|gb|DB982229.1|DB982229
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|11687281|gb|BF595017.1|BF595017
EST:     TTTGCTATTGGTATTAATGCNCGAGAACAACCAGANGAACTTNCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: TTTGCTATTGGTATTAATGC-CGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|14011128|gb|BG726059.1|BG726059
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|213598298|gb|DB979713.1|DB979713
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|209723806|gb|BW675204.1|BW675204
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|209718724|gb|BW671925.1|BW671925
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|14011401|gb|BG726323.1|BG726323
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|209708472|gb|BW665449.1|BW665449
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|209719758|gb|BW674909.1|BW674909
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|13790794|gb|BG653385.1|BG653385
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATG
EST: gi|11687983|gb|BF595659.1|BF595659
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|6915534|gb|AW397064.1|AW397064
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|5057360|gb|AI735836.1|AI735836
EST:     CTTTGATATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|298196451|gb|HO041194.1|HO041194
EST:     CTTTGCCATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGGTAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|6915789|gb|AW397319.1|AW397319
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|11688043|gb|BF595719.1|BF595719
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|213601927|gb|DB980251.1|DB980251
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|6747380|gb|AW317836.1|AW317836
EST:     ATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: ATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|46492887|gb|CN472443.1|CN472443
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|7232816|gb|AW568169.1|AW568169
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAA                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|16283120|gb|BI945382.1|BI945382
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|6915375|gb|AW396905.1|AW396905
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|9987340|gb|BE661448.1|BE661448
EST:     TTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGANGGA-CTTNCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: TTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGA-GGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|209721165|gb|BW665709.1|BW665709
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|209721884|gb|BW680043.1|BW680043
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|5057371|gb|AI735847.1|AI735847
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|298178740|gb|HO024475.1|HO024475
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATA
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATA
EST: gi|298169756|gb|HO021116.1|HO021116
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|6914055|gb|AW395585.1|AW395585
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|209699567|gb|BW683033.1|BW683033
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|213601884|gb|DB976173.1|DB976173
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|214004897|gb|DB989043.1|DB989043
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|214005773|gb|DB988037.1|DB988037
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|6747379|gb|AW317835.1|AW317835
EST:     CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAG                         GTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
genomic: CTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatt ... aaacttgaagGTTCGCAAGACAATGTGATAAGCCAGATACCTAGTCAAGTGCAGGAGCTTG
EST: gi|209709267|gb|BW678686.1|BW678686
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
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ATCCCAGCAGGTTATCCAGTTGTGGTCAACGCTACCTCAAATCTGAATTTCTTTGCTATTGGTATTAATGCCGAGAACAACCAGAGGAACTTCCTCGCAGgtatataatttatatatcacaatcaaatagaatattgttgttacttttttgttttattgcatgtgaaacatagccgcctgagttatttcaaacctaaacttggtgattgaaaacttgaag

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