1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtgagtattatttacttaataaacatcatcacttgcttctgcttcttgtaaaattatgatgatgaatttgttctgttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACTTCAATCTGGTGATGCCCTGAGAGTCCCCTCAGGAACCACATACTATGT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G28650.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|6964352|gb|AW433045.1|AW433045
genomic: ATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|14011125|gb|BG726056.1|BG726056
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|13787921|gb|BG650513.1|BG650513
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|11687301|gb|BF594941.1|BF594941
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|5057627|gb|AI736103.1|AI736103
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|298170715|gb|HO015691.1|HO015691
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|298196438|gb|HO041181.1|HO041181
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGTTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|5342593|gb|AI794877.1|AI794877
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|13790702|gb|BG653293.1|BG653293
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|6915682|gb|AW397212.1|AW397212
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: GACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|6747508|gb|AW317964.1|AW317964
genomic: GACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|13787950|gb|BG650542.1|BG650542
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|13788039|gb|BG650631.1|BG650631
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|11689020|gb|BF596626.1|BF596626
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|5510431|gb|AI856815.1|AI856815
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|11688983|gb|BF596589.1|BF596589
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|298177722|gb|HO023741.1|HO023741
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|5342852|gb|AI795136.1|AI795136
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|5126911|gb|AI748647.1|AI748647
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|5126919|gb|AI748655.1|AI748655
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|6916329|gb|AW397859.1|AW397859
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|298168226|gb|HO013489.1|HO013489
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: TGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|12772832|gb|BG237759.1|BG237759
genomic: TGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|5126943|gb|AI748679.1|AI748679
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|6747315|gb|AW317771.1|AW317771
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|7042643|gb|AW472537.1|AW472537
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|11688005|gb|BF595681.1|BF595681
genomic: CTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|5057477|gb|AI735953.1|AI735953
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: AACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|5126557|gb|AI748293.1|AI748293
genomic: AACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|9987341|gb|BE661449.1|BE661449
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|5126504|gb|AI748240.1|AI748240
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|6916232|gb|AW397762.1|AW397762
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|5688178|gb|AI941193.1|AI941193
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|6916440|gb|AW397970.1|AW397970
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|13788283|gb|BG650875.1|BG650875
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|14011224|gb|BG726146.1|BG726146
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|5127016|gb|AI748752.1|AI748752
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACEST: gi|11688154|gb|BF595830.1|BF595830
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
EST: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACG GGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
genomic: CCTTCTCCCCAACCATGCTGACGCTGATTACCTCATCGTTATCCTTAACGgtgagtatta ... ttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGAC
acttgcttctgcttcttgtaaaattatgatgatgaatttgttctgttaattacagGGACTGCCATTCTTTCCTTGGTGAACAACGACGACAGAGACTCCTACAGACTTCAATCTGGTGATGCCCTGAGAGTCCCCTCAGGAACCACATACTATGT
tgttaat putative branch site (score: 3)
ttctgtt CT-rich tract
taaaattatgatgatg TA-rich tract